180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4754 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4754  sulfatase family protein  100 
 
 
499 aa  1036    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00782  predicted hydrolase, inner membrane  30.41 
 
 
527 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2827  sulfatase  30.41 
 
 
527 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.274935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2828  sulfatase  30.41 
 
 
527 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0964  sulfatase family protein  30.41 
 
 
527 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00476272  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00799  hypothetical protein  30.41 
 
 
527 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0872  sulfatase family protein  30.41 
 
 
527 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0491523  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2533  sulfatase family protein  30.41 
 
 
527 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768289  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0839  sulfatase family protein  30.41 
 
 
527 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.195944  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0885  sulfatase family protein  30.9 
 
 
527 aa  234  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0481411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1302  sulfatase  30.08 
 
 
527 aa  233  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.557571  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0900  inner membrane protein YbiP  32.57 
 
 
526 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0984  inner membrane protein YbiP  32.57 
 
 
526 aa  223  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0963  hypothetical protein  32.57 
 
 
526 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0872  inner membrane protein YbiP  32.57 
 
 
526 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0930  inner membrane protein YbiP  32.35 
 
 
526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3663  sulfatase  32.86 
 
 
512 aa  221  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0688  sulfatase  30.57 
 
 
517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4736  hypothetical protein  27.6 
 
 
515 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04430  hypothetical protein  23.67 
 
 
589 aa  106  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.117859  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03039  predicted hydrolase, inner membrane  31.98 
 
 
541 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0533  sulfatase  31.98 
 
 
547 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02990  hypothetical protein  31.98 
 
 
541 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3469  inner membrane protein yhbX  33.06 
 
 
505 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0525732  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0526  sulfatase  31.98 
 
 
541 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3365  inner membrane protein yhbX  31.98 
 
 
541 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00782202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3658  inner membrane protein yhbX  31.98 
 
 
541 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0592797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4495  inner membrane protein yhbX  31.98 
 
 
505 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0722596  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1905  hypothetical protein  30.03 
 
 
553 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0774  putative membrane-associated, metal-dependent hydrolase  27.58 
 
 
560 aa  100  7e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000171309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2584  hypothetical protein  23.31 
 
 
583 aa  100  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4523  hypothetical protein  26.02 
 
 
577 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000496918 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4446  hypothetical protein  26.02 
 
 
577 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4359  hypothetical protein  26.02 
 
 
577 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5415  hypothetical protein  25.56 
 
 
577 aa  94  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4328  hypothetical protein  26.02 
 
 
577 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91856  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4402  hypothetical protein  23.16 
 
 
577 aa  94  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.256321  normal  0.491316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4449  hypothetical protein  25.71 
 
 
577 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4610  sulfatase  30 
 
 
592 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1711  sulfatase  28.41 
 
 
551 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155197  normal  0.648833 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4031  sulfatase  25.24 
 
 
577 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03840  conserved inner membrane protein  25.24 
 
 
577 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4441  hypothetical protein  25.24 
 
 
577 aa  91.3  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03789  hypothetical protein  25.24 
 
 
577 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4189  hypothetical protein  25.24 
 
 
577 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4494  hypothetical protein  25.24 
 
 
577 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4061  hypothetical protein  25.24 
 
 
577 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0093  sulfatase  30.18 
 
 
550 aa  90.9  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0113  hypothetical protein  25.81 
 
 
573 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2579  hypothetical protein  27.92 
 
 
584 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3137  hypothetical protein  28.03 
 
 
584 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1154  sulfatase  25 
 
 
564 aa  87  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.614879  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1039  integral membrane protein  29.81 
 
 
575 aa  87  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58610  hypothetical protein  26.05 
 
 
600 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2111  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  23.06 
 
 
571 aa  83.6  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5131  hypothetical protein  26.37 
 
 
600 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3283  hypothetical protein  27.27 
 
 
592 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3401  sulfatase  27.76 
 
 
614 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0756  hypothetical protein  21.32 
 
 
565 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.112418 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04885  sulfatase domain protein  29.05 
 
 
552 aa  73.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2902  sulfatase  27.37 
 
 
553 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1777  sulfatase domain-containing protein  21.87 
 
 
589 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1859  phosphoethanolamine transferase  26.47 
 
 
554 aa  67.4  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0021  sulfatase  28.85 
 
 
524 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1018  sulfatase  22.97 
 
 
544 aa  67  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663871  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1048  sulfatase  22.65 
 
 
580 aa  65.1  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3264  putative sulfatase  27.02 
 
 
556 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225612  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3435  sulfatase  26.42 
 
 
560 aa  64.3  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0802  sulfatase  26.02 
 
 
531 aa  63.9  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2500  hypothetical protein  27.16 
 
 
573 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.549124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4017  phosphoethanolamine transferase  24.15 
 
 
563 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.363242  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3957  phosphoethanolamine transferase  24.15 
 
 
563 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00895606  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3913  phosphoethanolamine transferase  24.15 
 
 
563 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.291921  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3835  phosphoethanolamine transferase  24.15 
 
 
563 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00912049  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3848  phosphoethanolamine transferase  24.15 
 
 
563 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.632743  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3282  sulfatase  27.69 
 
 
583 aa  60.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100906  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2985  sulfatase  26.41 
 
 
544 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0251459 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0141  hypothetical protein  22.3 
 
 
502 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0131  phosphoethanolamine transferase  24.23 
 
 
564 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.173638  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00378  putative sulfatase  28.03 
 
 
300 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3478  sulfatase  23.04 
 
 
541 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1810  hypothetical protein  28.11 
 
 
551 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4248  lipid A phosphoethanolamine transferase  24.31 
 
 
508 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3642  sulfatase  25 
 
 
560 aa  57  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418054  normal  0.084742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5584  hypothetical protein  24.48 
 
 
549 aa  57  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0236  sulfatase  25.2 
 
 
535 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21210  hypothetical protein  27.71 
 
 
551 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1978  sulfatase  25.85 
 
 
545 aa  56.2  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05289  lipid A phosphoethanolamine transferase  23.91 
 
 
550 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4143  phosphoethanolamine transferase  24.58 
 
 
560 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2097  sulfatase  27.35 
 
 
541 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000583  hypothetical protein  23.67 
 
 
551 aa  55.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2326  sulfatase  26.38 
 
 
547 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.995391  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4122  sulfatase  27.83 
 
 
545 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0166  sulfatase  23.48 
 
 
563 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1245  sulfatase  24.24 
 
 
572 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.761831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0080  phosphoethanolamine transferase  24.91 
 
 
563 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0170  phosphoethanolamine transferase  23.48 
 
 
563 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03347  hypothetical protein  23.48 
 
 
563 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4133  phosphoethanolamine transferase  24.91 
 
 
563 aa  55.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.257424 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>