More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4563 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4563  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 		 252 aa  507  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5610  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  99.6 
 
 		 252 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03969  carbon-phosphorus lyase complex subunit  99.21 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3894  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  99.21 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4651  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  98.81 
 
 		 252 aa  501  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4338  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  98.81 
 
 		 252 aa  502  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  99.21 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03929  hypothetical protein  99.21 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0301  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  95.2 
 
 		 251 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4027  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  85.49 
 
 		 263 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3698  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  85.49 
 
 		 263 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3564  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  85.49 
 
 		 262 aa  434  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0517  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  85.32 
 
 		 262 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  85.83 
 
 		 273 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  84.15 
 
 		 262 aa  417  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  83.13 
 
 		 254 aa  417  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.77 
 
 		 262 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.38 
 
 		 262 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2882  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  71.26 
 
 		 269 aa  358  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0274  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.63 
 
 		 258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2192  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.24 
 
 		 258 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20400  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  71.37 
 
 		 271 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110651  normal  0.49891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2563  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  71.65 
 
 		 273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1753  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.59 
 
 		 271 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2255  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  71.65 
 
 		 273 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000530025  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4434  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.84 
 
 		 258 aa  345  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4120  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.98 
 
 		 258 aa  344  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3332  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.11 
 
 		 284 aa  343  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4778  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.76 
 
 		 260 aa  342  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  0.35491 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4231  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.59 
 
 		 258 aa  339  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.503556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2961  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.62 
 
 		 257 aa  337  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.32 
 
 		 256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.02 
 
 		 262 aa  335  3.9999999999999995e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.4 
 
 		 258 aa  334  7.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000264723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0817  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.19 
 
 		 257 aa  333  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2910  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.67 
 
 		 257 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.838485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3829  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.17 
 
 		 266 aa  325  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.179517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6094  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.03 
 
 		 263 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991353  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0758  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.17 
 
 		 272 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5844  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.17 
 
 		 264 aa  322  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4093  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.53 
 
 		 266 aa  321  8e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4211  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.43 
 
 		 256 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3852  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.1 
 
 		 257 aa  317  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.96 
 
 		 265 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4190  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.4 
 
 		 258 aa  310  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2915  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.6 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.78 
 
 		 262 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5944  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.48 
 
 		 256 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0141  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.31 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2183  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.48 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481502  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1181  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.08 
 
 		 256 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3307  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.08 
 
 		 256 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3341  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.08 
 
 		 256 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2590  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.08 
 
 		 256 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3777  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.08 
 
 		 256 aa  298  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2404  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 		 256 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0320  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 		 256 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3353  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  65.08 
 
 		 611 aa  298  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403888  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  59.13 
 
 		 260 aa  292  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  59.13 
 
 		 260 aa  292  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5001  ABC transporter related  47.27 
 
 		 276 aa  244  9e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.20285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0428  ABC type ATPase  52.52 
 
 		 283 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0464  ABC type ATPase  52.52 
 
 		 283 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.849392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2292  ABC phosphonate transport system ATPase  46.21 
 
 		 276 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2086  ABC transporter related  45.29 
 
 		 278 aa  232  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2293  ABC transporter related  52.59 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4145  ABC transporter related  52.59 
 
 		 276 aa  229  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4041  ABC transporter related  50.64 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0221  ABC transporter related  50.64 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3788  ABC transporter related  50.22 
 
 		 276 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3839  ABC transporter related  50.22 
 
 		 276 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.588878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3688  ABC transporter for phosphonate ATP-binding protein  46.98 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1587  ABC transporter related  51.07 
 
 		 280 aa  218  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3508  ABC transporter related  50.21 
 
 		 279 aa  218  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0232  ABC transporter related  41.45 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5869  ABC transporter-related protein  41.7 
 
 		 291 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  41.25 
 
 		 593 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  39.62 
 
 		 612 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  39.85 
 
 		 613 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  38.46 
 
 		 611 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  37.69 
 
 		 609 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.37 
 
 		 617 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3799  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.02 
 
 		 364 aa  171  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  39.46 
 
 		 619 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  39.15 
 
 		 597 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  39.91 
 
 		 611 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  35.27 
 
 		 539 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.86 
 
 		 643 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4179  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 		 364 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0025  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 347 aa  168  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.408235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0680  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.55 
 
 		 332 aa  168  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0938  ABC transporter related  36.47 
 
 		 686 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  38.98 
 
 		 583 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.62 
 
 		 611 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  39.11 
 
 		 536 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0965  ABC transporter related  35.71 
 
 		 686 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.346759 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.55 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.991753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  37.07 
 
 		 610 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  39.46 
 
 		 613 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  37.07 
 
 		 601 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>