72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4217 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  99 
 
 		 201 aa  401  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  99 
 
 		 201 aa  401  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  99 
 
 		 201 aa  401  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  99 
 
 		 201 aa  401  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  99 
 
 		 201 aa  401  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  99 
 
 		 201 aa  401  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  99 
 
 		 201 aa  401  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  98.51 
 
 		 201 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  89.05 
 
 		 201 aa  360  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  88.56 
 
 		 201 aa  358  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  88.56 
 
 		 201 aa  358  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  87.56 
 
 		 201 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  87.06 
 
 		 201 aa  354  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  82.09 
 
 		 201 aa  340  7e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  59.7 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  56.78 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  56.28 
 
 		 216 aa  228  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  54.27 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  52.26 
 
 		 202 aa  211  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  50.75 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  47.8 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  46.92 
 
 		 213 aa  204  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  38.89 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  40.69 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  37.81 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  36.82 
 
 		 207 aa  140  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  34.18 
 
 		 210 aa  127  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  31.28 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  26.63 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  26.63 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  25.91 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  27.46 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  26.94 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  26.94 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  26.94 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  26.94 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  29.56 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  25.91 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  26.42 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  30.15 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  30.61 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  30.1 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  29.35 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  29.05 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  28.82 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  30.6 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  27.32 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  28.35 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  29.79 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  28.92 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  27.32 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  25.29 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  25.29 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  25.26 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  27.18 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  24.74 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  25.26 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  27.09 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  25.26 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  26.29 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  23.65 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  28.5 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  26.8 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  21.61 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  25.42 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  21.61 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  30.21 
 
 		 208 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  30.21 
 
 		 208 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  30.21 
 
 		 208 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  30.21 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  28.43 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>