23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4053 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4053  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  178  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0015  protein of unknown function DUF1375  97.67 
 
 
110 aa  177  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03515  hypothetical protein  97.67 
 
 
110 aa  177  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4231  hypothetical protein  97.67 
 
 
135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0015  hypothetical protein  97.67 
 
 
135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4197  hypothetical protein  97.67 
 
 
135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03571  conserved outer membrane protein  97.67 
 
 
110 aa  177  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3900  hypothetical protein  97.67 
 
 
135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5121  hypothetical protein  97.67 
 
 
86 aa  176  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.180552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4037  hypothetical protein  89.29 
 
 
96 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4020  hypothetical protein  89.29 
 
 
96 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4199  hypothetical protein  89.29 
 
 
96 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4092  hypothetical protein  89.29 
 
 
86 aa  159  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4141  hypothetical protein  89.29 
 
 
86 aa  159  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0012  hypothetical protein  82.14 
 
 
110 aa  148  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.554308  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3915  protein of unknown function DUF1375  46.67 
 
 
123 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0033  hypothetical protein  42.86 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0038  hypothetical protein  42.86 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0047  hypothetical protein  49.32 
 
 
114 aa  76.6  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.320831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4144  hypothetical protein  43.21 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0010  hypothetical protein  43.21 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3796  hypothetical protein  43.21 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4106  protein of unknown function DUF1375  43.84 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>