More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3802 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  84.4 
 
 
661 aa  1165    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  99.85 
 
 
660 aa  1353    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  100 
 
 
660 aa  1354    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  67.85 
 
 
676 aa  947    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  67.7 
 
 
676 aa  946    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  67.7 
 
 
676 aa  946    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  66.91 
 
 
694 aa  931    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  31.33 
 
 
676 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.44 
 
 
694 aa  271  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.21 
 
 
696 aa  230  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.13 
 
 
695 aa  226  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.83 
 
 
688 aa  219  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.51 
 
 
696 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  28.59 
 
 
697 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.03 
 
 
681 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  28.23 
 
 
690 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.37 
 
 
696 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.67 
 
 
696 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.53 
 
 
696 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.29 
 
 
734 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.5 
 
 
677 aa  180  9e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.61 
 
 
704 aa  171  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.39 
 
 
862 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.3 
 
 
743 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.83 
 
 
861 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.78 
 
 
722 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.01 
 
 
859 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.83 
 
 
697 aa  162  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.3 
 
 
862 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.03 
 
 
862 aa  160  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.06 
 
 
685 aa  158  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.84 
 
 
646 aa  156  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  28.12 
 
 
857 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.64 
 
 
717 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  25.75 
 
 
764 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  25.25 
 
 
764 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.71 
 
 
689 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.29 
 
 
849 aa  152  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.79 
 
 
867 aa  150  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.8 
 
 
716 aa  150  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.08 
 
 
686 aa  143  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  25.36 
 
 
778 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.76 
 
 
779 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.21 
 
 
892 aa  139  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  25.54 
 
 
698 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.09 
 
 
892 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.52 
 
 
778 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3124  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 
791 aa  130  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.41 
 
 
750 aa  130  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  25.43 
 
 
712 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  24.54 
 
 
668 aa  127  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  26.55 
 
 
668 aa  127  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.98 
 
 
657 aa  127  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  26.45 
 
 
490 aa  126  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0347  TonB-dependent receptor, plug  24.96 
 
 
670 aa  125  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.9 
 
 
739 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.9 
 
 
739 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  26.16 
 
 
650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.91 
 
 
650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.59 
 
 
737 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  26.06 
 
 
650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  25.32 
 
 
693 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  25.57 
 
 
830 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.7 
 
 
739 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.9 
 
 
739 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.91 
 
 
650 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  25.91 
 
 
650 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  24.8 
 
 
830 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  28.36 
 
 
891 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.12 
 
 
783 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 
681 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 
683 aa  118  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1858  heme transport protein HugA  21.51 
 
 
683 aa  118  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.16 
 
 
730 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 
680 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.08 
 
 
754 aa  117  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 
649 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 
662 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 
661 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  22.61 
 
 
737 aa  115  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 
662 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  25.11 
 
 
659 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.96 
 
 
663 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.8 
 
 
759 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.96 
 
 
663 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 
662 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.9 
 
 
669 aa  114  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  24.96 
 
 
663 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 
663 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  24.96 
 
 
663 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  24.96 
 
 
663 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 
649 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03722  outer membrane hemin receptor signal peptide protein  26.54 
 
 
741 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000281288  normal  0.0836882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 
648 aa  112  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 
649 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 
702 aa  112  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  26.04 
 
 
656 aa  111  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.5 
 
 
762 aa  111  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
635 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 
657 aa  110  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>