296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3709 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0285  hypothetical protein  91.62 
 
 		 505 aa  940    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4738  hypothetical protein  90.66 
 
 		 471 aa  875    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3906  hypothetical protein  90.82 
 
 		 501 aa  945    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3709  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  1030    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.447391 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03232  hypothetical protein  91.02 
 
 		 501 aa  946    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3626  hypothetical protein  92.99 
 
 		 371 aa  704    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3898  putative periplasmic phosphate-binding protein  50.5 
 
 		 498 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  0.815113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3795  putative periplasmic phosphate-binding protein  50.51 
 
 		 486 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0718968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3729  putative periplasmic phosphate-binding protein  50.71 
 
 		 486 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3836  putative periplasmic phosphate-binding protein  64.81 
 
 		 280 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3708  hypothetical protein  59.44 
 
 		 330 aa  342  9e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03279  hypothetical protein  57.53 
 
 		 330 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0286  hypothetical protein  57.53 
 
 		 330 aa  341  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4737  hypothetical protein  57.53 
 
 		 330 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03231  hypothetical protein  57.53 
 
 		 330 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3625  hypothetical protein  57.19 
 
 		 330 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1350  putative periplasmic phosphate-binding protein  40.56 
 
 		 498 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3376  putative periplasmic phosphate-binding protein  42.72 
 
 		 335 aa  272  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000120195  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3377  putative periplasmic phosphate-binding protein  39.63 
 
 		 326 aa  261  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000468434  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3812  hypothetical membrane protein  95.24 
 
 		 106 aa  210  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843933  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3721  putative periplasmic phosphate-binding protein  73.39 
 
 		 124 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.449275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1068  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  35.38 
 
 		 835 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0358436  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1989  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  36.96 
 
 		 630 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000844376  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0889  hypothetical protein  28.75 
 
 		 444 aa  154  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.181137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0121  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  29.08 
 
 		 336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0287  conserved hypothetical protein  76.54 
 
 		 93 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  34.56 
 
 		 301 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.83 
 
 		 272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  32.12 
 
 		 287 aa  110  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  33 
 
 		 270 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  31.46 
 
 		 298 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.31 
 
 		 218 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  34.83 
 
 		 281 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  29.3 
 
 		 296 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  28.57 
 
 		 272 aa  106  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  35.91 
 
 		 284 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.09 
 
 		 288 aa  104  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  32.11 
 
 		 268 aa  103  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  30.04 
 
 		 271 aa  103  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.63 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.63 
 
 		 300 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.81 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  28.85 
 
 		 308 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.85 
 
 		 308 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.85 
 
 		 308 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  30.7 
 
 		 272 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  27.84 
 
 		 272 aa  101  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.85 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  28.85 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.85 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  28.85 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  34.73 
 
 		 274 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  30.23 
 
 		 272 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.25 
 
 		 278 aa  100  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  33.5 
 
 		 282 aa  99.8  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  31.94 
 
 		 278 aa  100  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  30.23 
 
 		 272 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  32.24 
 
 		 272 aa  99.4  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  30 
 
 		 306 aa  99.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  28.85 
 
 		 304 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  34.44 
 
 		 283 aa  98.6  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  27.45 
 
 		 271 aa  97.8  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  32.99 
 
 		 272 aa  97.1  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1647  phosphate transport system substrate-binding protein  29.34 
 
 		 276 aa  96.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  29.91 
 
 		 278 aa  96.3  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  31.09 
 
 		 280 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  26.56 
 
 		 270 aa  94.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  31.25 
 
 		 273 aa  94.4  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  28.4 
 
 		 271 aa  94.4  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  26.88 
 
 		 276 aa  93.2  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  29.63 
 
 		 292 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  34.68 
 
 		 294 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  29.78 
 
 		 278 aa  92.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  31.46 
 
 		 279 aa  90.9  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  26.98 
 
 		 290 aa  90.5  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  31.28 
 
 		 292 aa  89.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  32.8 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  30.05 
 
 		 281 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  33.67 
 
 		 274 aa  89  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.99 
 
 		 286 aa  88.6  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  31.15 
 
 		 281 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  34.12 
 
 		 309 aa  88.2  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  35.26 
 
 		 303 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  31.46 
 
 		 281 aa  87.4  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  31.03 
 
 		 381 aa  86.7  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32 
 
 		 291 aa  86.3  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  30.94 
 
 		 273 aa  85.9  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.41 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.29 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  24.9 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  29.5 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  29.03 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  29.94 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  24.43 
 
 		 264 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  27.53 
 
 		 272 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.93 
 
 		 302 aa  83.2  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  31.34 
 
 		 273 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.9 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  32.04 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  28.12 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>