129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3457 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  99.28 
 
 		 414 aa  815    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  99.03 
 
 		 414 aa  814    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3634  tryptophan permease  94.2 
 
 		 414 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  99.28 
 
 		 414 aa  815    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  99.03 
 
 		 414 aa  812    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  94.69 
 
 		 414 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3466  tryptophan permease  94.44 
 
 		 414 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  94.69 
 
 		 414 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  93.48 
 
 		 414 aa  743    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  99.28 
 
 		 414 aa  815    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3643  tryptophan permease  99.28 
 
 		 414 aa  814    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  99.28 
 
 		 414 aa  815    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0411186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3457  tryptophan permease  100 
 
 		 414 aa  820    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813995 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  99.52 
 
 		 414 aa  816    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  94.44 
 
 		 414 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  75.79 
 
 		 424 aa  627  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  73.84 
 
 		 424 aa  610  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  65.37 
 
 		 467 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  65.12 
 
 		 417 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  59.11 
 
 		 414 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  57.66 
 
 		 414 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  55.93 
 
 		 425 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  57.42 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  57.42 
 
 		 412 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  59.16 
 
 		 418 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  59.16 
 
 		 418 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  58.91 
 
 		 418 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  59.16 
 
 		 418 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  57.35 
 
 		 414 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  58.17 
 
 		 418 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  58.17 
 
 		 418 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  56.87 
 
 		 418 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  60 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  57.35 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  58.72 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  56.33 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  58.13 
 
 		 418 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  58.52 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  58.31 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  52.57 
 
 		 415 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  51.69 
 
 		 416 aa  420  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  55.91 
 
 		 418 aa  418  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  52.57 
 
 		 415 aa  418  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  52.08 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  52.08 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  52.32 
 
 		 415 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  52.08 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  52.08 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4213  tryptophan permease TnaB  51.83 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  46.91 
 
 		 419 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  43.42 
 
 		 409 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0800  tryptophan permease  44.25 
 
 		 409 aa  317  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.121788  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1118  tryptophan-specific transport protein  44.12 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  34.38 
 
 		 402 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  34.38 
 
 		 402 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  34.38 
 
 		 402 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  33.58 
 
 		 403 aa  216  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  32.41 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  33.58 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  33.58 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  33.58 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  33.58 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  33.58 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  33.58 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  33.58 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  33.58 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  34.11 
 
 		 422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  34.18 
 
 		 402 aa  213  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  33.85 
 
 		 422 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  33.85 
 
 		 422 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  33.85 
 
 		 422 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  33.85 
 
 		 422 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  33.33 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  34.18 
 
 		 402 aa  203  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  30.67 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  32.06 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  31.41 
 
 		 400 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  33.25 
 
 		 425 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  31.81 
 
 		 395 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  32.98 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  31.81 
 
 		 395 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  31.3 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  29.77 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  29.01 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  29.01 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  29.01 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  29.01 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  29.44 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  28.04 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  28.12 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  28.2 
 
 		 390 aa  160  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  28.76 
 
 		 392 aa  159  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  28.72 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  28.73 
 
 		 399 aa  156  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  28.28 
 
 		 380 aa  155  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  30.08 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  28.42 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2939  tyrosine-specific transport protein, putative  30.47 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  29.47 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  29.71 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>