70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3335 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3335  putative disulfide oxidoreductase  100 
 
 		 218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3547  putative disulfide oxidoreductase  87.16 
 
 		 225 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.668443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3452  putative disulfide oxidoreductase  87.16 
 
 		 225 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3445  putative disulfide oxidoreductase  87.16 
 
 		 225 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3380  putative disulfide oxidoreductase  87.16 
 
 		 225 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3375  putative disulfide oxidoreductase  87.16 
 
 		 225 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0434  putative disulfide oxidoreductase  60.37 
 
 		 215 aa  285  4e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.679681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1381  putative disulfide oxidoreductase  55.3 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  normal  0.0714776 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1437  putative disulfide oxidoreductase  55.3 
 
 		 224 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260766 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1146  putative disulfide oxidoreductase  52.53 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0003  putative disulfide oxidoreductase  51.53 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1014  putative disulfide oxidoreductase  47.62 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00012022  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0952  putative disulfide oxidoreductase  47.62 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.147745  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0881  putative disulfide oxidoreductase  45.97 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.554065  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1623  disulfide bond formation protein B  40.21 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0235  disulfide bond formation protein  37.61 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4000  disulfide bond formation protein  35.14 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0837638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4029  disulphide bond formation protein DsbB  35.27 
 
 		 207 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4024  disulphide bond formation protein DsbB  34.86 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3870  disulfide bond formation protein  34.7 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  34.46 
 
 		 172 aa  84.7  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  33.54 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  32.12 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1633  disulphide bond formation protein DsbB  35.17 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000198857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  32.73 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  31.52 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  31.52 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  31.52 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1741  disulphide bond formation protein DsbB  33.79 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  33.12 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  33.13 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  31.74 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  31.74 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  31.14 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  31.74 
 
 		 175 aa  72  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  30.18 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  36.36 
 
 		 172 aa  67.8  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2176  disulfide bond formation protein B  32.84 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  hitchhiker  0.0087619 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  28.79 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1660  disulfide bond formation protein B  31.82 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  32.87 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  31.47 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  34.06 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  34.62 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  34.62 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  34.62 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  34.62 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2149  disulfide bond formation protein B  32.58 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  33.85 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2367  disulfide bond formation protein B  34.35 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000380886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  32.12 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2242  disulfide bond formation protein B  31.82 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  31.85 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  32.33 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1946  disulfide bond formation protein B  32.73 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  29.37 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  30.83 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  30.83 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  30.83 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  30.83 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  30.83 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  30.83 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  30.83 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  30.83 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  30.83 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  30.83 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  29.93 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  29.93 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  29.93 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  30.91 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>