225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3327 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3327  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  100 
 
 
275 aa  564  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.654688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3210  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  99.64 
 
 
275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.179691  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3465  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  99.64 
 
 
275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.481637  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4346  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  99.64 
 
 
275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3496  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  99.64 
 
 
275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02904  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  99.27 
 
 
275 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0668  Calcineurin phosphoesterase domain protein  99.27 
 
 
275 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02854  hypothetical protein  99.27 
 
 
275 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0665  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  98.55 
 
 
274 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0159191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3369  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  92 
 
 
275 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3441  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  92 
 
 
275 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3434  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  92 
 
 
275 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3364  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  92 
 
 
275 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3536  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  92 
 
 
275 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3445  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  83.27 
 
 
275 aa  448  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  70.55 
 
 
275 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  70.18 
 
 
275 aa  408  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  70.18 
 
 
299 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  69.09 
 
 
275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  68.36 
 
 
275 aa  401  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0317  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  70.55 
 
 
275 aa  391  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0326  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  70.55 
 
 
275 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  71.03 
 
 
280 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  49.25 
 
 
276 aa  293  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00872  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  55.56 
 
 
268 aa  287  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004519  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  55.17 
 
 
268 aa  277  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16665  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2010  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  53.03 
 
 
272 aa  276  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2672  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  52.49 
 
 
274 aa  276  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3233  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  45.88 
 
 
279 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.848486  hitchhiker  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0728  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  46.24 
 
 
279 aa  258  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.799636  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  45.88 
 
 
279 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0784  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  45.52 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.611583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0816  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  45.52 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103731  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3575  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  45.52 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0809  Calcineurin phosphoesterase domain protein  45.52 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3901  lacZ expression regulator  45.16 
 
 
278 aa  250  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4192  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  43.01 
 
 
279 aa  248  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404354 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  43.3 
 
 
278 aa  247  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0777  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  42.65 
 
 
279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00052744  hitchhiker  0.00000000244618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0771  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  44.09 
 
 
279 aa  242  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0672533  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  45.49 
 
 
271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3222  metallophosphoesterase  43.77 
 
 
279 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00294864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3560  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  41.58 
 
 
279 aa  228  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00638886  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3329  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  42.8 
 
 
279 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.217792  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0547  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  41.79 
 
 
279 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.352525  normal  0.353099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  45.52 
 
 
269 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3045  lacZ expression regulator  43.12 
 
 
279 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.396256  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  44.7 
 
 
268 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  45.95 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  42.91 
 
 
271 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  45.08 
 
 
272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  43.61 
 
 
272 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  43.3 
 
 
268 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4970  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  42.16 
 
 
266 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  42.54 
 
 
266 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  42.16 
 
 
266 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  42.53 
 
 
266 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0372  icc protein  42.05 
 
 
271 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4709  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  42.55 
 
 
267 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.771801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  41.87 
 
 
259 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  37.65 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  39.75 
 
 
266 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0192  metallophosphoesterase  38.02 
 
 
270 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  37.05 
 
 
251 aa  148  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  33.73 
 
 
265 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2339  metallophosphoesterase  32.58 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2036  cyclic AMP phosphodiesterase  32.71 
 
 
279 aa  133  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.065067 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0181  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  33.06 
 
 
340 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367464  hitchhiker  0.00819669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  34.52 
 
 
244 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4178  cyclic AMP phosphodiesterase  31.78 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  34.95 
 
 
275 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  34.52 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  32.71 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  36.18 
 
 
280 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03687  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.72 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00113636  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  31.19 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0534  putative ICC protein  26.51 
 
 
279 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  32.28 
 
 
278 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  26.61 
 
 
290 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  32.05 
 
 
263 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  33.69 
 
 
239 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  33.69 
 
 
239 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  30.13 
 
 
276 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1772  ICC (3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase) protein  32.95 
 
 
253 aa  99.4  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131867  normal  0.0325302 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  32.52 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0433  metallophosphoesterase  30.08 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.27 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  29.17 
 
 
276 aa  95.5  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  30.22 
 
 
245 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0061  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  24.11 
 
 
237 aa  95.1  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  29.36 
 
 
270 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  31.31 
 
 
318 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  28.03 
 
 
277 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  26.42 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  29.54 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  27.41 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  31.4 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  27.65 
 
 
275 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  27.19 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  28.44 
 
 
275 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>