More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3233 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  100 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  68.14 
 
 		 207 aa  290  8e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  35.21 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  33.01 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  29.72 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  34.15 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  25.36 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  30.5 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  26.79 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  31.53 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  27.27 
 
 		 211 aa  95.5  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  32.35 
 
 		 195 aa  93.2  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  25.6 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  30.43 
 
 		 226 aa  91.3  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  25.59 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  30.14 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01111  hypothetical protein  30.93 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.238768 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  30.69 
 
 		 194 aa  88.2  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  31.22 
 
 		 204 aa  88.2  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  28.57 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  31.66 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  26.92 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  33.9 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  28.17 
 
 		 218 aa  85.1  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  30.14 
 
 		 202 aa  84.7  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  26.57 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.57 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  25.59 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  28.17 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  22.64 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  27.59 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  29 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  33.67 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  27.4 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5367  hexapaptide repeat-containing transferase  28.21 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  24.41 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3879  hexapeptide repeat-containing transferase  25.84 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3457  hexapeptide transferase family protein  25.36 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2882  hexapeptide transferase family protein  25.36 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0101  hexapeptide transferase family protein  25.84 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1662  hexapeptide transferase family protein  25.36 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3961  hexapeptide repeat-containing transferase  25.36 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3093  hexapeptide transferase family protein  25.36 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915098  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  25.63 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  27.36 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  24.5 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00987  acetyltransferase  26.07 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06179  acetyltransferase  26.07 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0364172  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  24.53 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  23.9 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  26.54 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  27.09 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  25.59 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  26.47 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  24.06 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  24.77 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  26.24 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  27.14 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  29.47 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  26.54 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.41 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  26.92 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  25.12 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  27.1 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  30.62 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  25.37 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  29 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  24.76 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  27.1 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  28.28 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  24.02 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  23.58 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  24.65 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  23.58 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00206  transferase hexapeptide repeat  23.15 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  23.08 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2767  putative serine O-acetyltransferase  25 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  25.12 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  22.79 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  25.37 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0284  hexapaptide repeat-containing transferase  20.77 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0293  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  28.8 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  24.5 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2251  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  36.54 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.916384  hitchhiker  0.00856582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2576  acetyltransferase  24.02 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.538596  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  21.43 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  30.37 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  26.45 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  24.47 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0703  Maltose O-acetyltransferase  30.09 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  21.57 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  23.7 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1900  maltose O-acetyltransferase  32.74 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  28.7 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  21.66 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  23.12 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  22.38 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  21.7 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>