153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3232 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  100 
 
 		 346 aa  706    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  68.6 
 
 		 346 aa  492  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  56.3 
 
 		 341 aa  385  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  51.49 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  50.89 
 
 		 334 aa  346  4e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  52.1 
 
 		 331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  52.96 
 
 		 334 aa  343  4e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  51.05 
 
 		 330 aa  339  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  50.15 
 
 		 333 aa  330  1e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.64 
 
 		 335 aa  330  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  51.34 
 
 		 333 aa  323  2e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.19 
 
 		 338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.13 
 
 		 334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  45.54 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  45.4 
 
 		 333 aa  299  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  48.35 
 
 		 349 aa  298  6e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.94 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.92 
 
 		 334 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.92 
 
 		 334 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  44.1 
 
 		 357 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  41 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  42.98 
 
 		 357 aa  279  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  48.15 
 
 		 348 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  42.55 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  41.09 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  42.22 
 
 		 363 aa  275  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  42.02 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  42.02 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  40.33 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  42.64 
 
 		 347 aa  269  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  43.79 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  43.79 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.45 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  41.02 
 
 		 358 aa  259  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  39 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2396  NeuB, antifreeze-like protein  38.78 
 
 		 371 aa  247  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  38.32 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  38.44 
 
 		 341 aa  241  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.26 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.5 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.56 
 
 		 350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  37.03 
 
 		 337 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.8 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.89 
 
 		 350 aa  212  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  33.73 
 
 		 348 aa  212  7.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.23 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.46 
 
 		 749 aa  209  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  35.58 
 
 		 350 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.13 
 
 		 350 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4853  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.19 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  36.92 
 
 		 350 aa  199  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  34.64 
 
 		 349 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.22 
 
 		 342 aa  193  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  37.12 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.34 
 
 		 350 aa  192  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  35.78 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  34.36 
 
 		 348 aa  190  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  35.1 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1912  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.45 
 
 		 365 aa  189  7e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000713145 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  34.56 
 
 		 350 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  34.02 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.05 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.39 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  34.98 
 
 		 350 aa  185  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1890  N-acetylneuraminate synthase  33.92 
 
 		 356 aa  185  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000120962  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  34.15 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  35.38 
 
 		 352 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  34.63 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1158  sialic acid synthase  36.98 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00143382  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  35.47 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.14 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  33.84 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.24 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  33.64 
 
 		 332 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  35.65 
 
 		 340 aa  180  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  32.56 
 
 		 748 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1574  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.01 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000030231  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.33 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1894  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.82 
 
 		 354 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  34.51 
 
 		 289 aa  176  7e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  36.09 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  33.94 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1274  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.97 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.86 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.53 
 
 		 749 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.53 
 
 		 749 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  32.93 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  32.42 
 
 		 761 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  33.83 
 
 		 347 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0910  N-acetylneuraminate synthase  34.15 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  35.79 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.55 
 
 		 355 aa  172  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  35.56 
 
 		 345 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  34.49 
 
 		 672 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  32.52 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.94 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.94 
 
 		 344 aa  171  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14241  sialic acid synthase  35.82 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.532641  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.18 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0346  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.21 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.417711 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>