33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2888 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4013  CRISPR-associated protein, Cse1 family  95.96 
 
 		 520 aa  1035    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3254  crispr-associated protein, Cse1 family  72.51 
 
 		 518 aa  742    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.552745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3071  crispr-associated protein, Cse1 family  68.79 
 
 		 519 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3137  Cse1 family CRISPR-associated protein  73.31 
 
 		 518 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.199062  normal  0.768115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2888  CRISPR-associated Cse1 family protein  100 
 
 		 520 aa  1073    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.447574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3062  CRISPR-associated Cse1 family protein  96.35 
 
 		 520 aa  1037    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0398  CRISPR-associated protein, Cse1 family  47.54 
 
 		 523 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000236732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  45.53 
 
 		 511 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3590  CRISPR-associated protein, Cse1 family  47.04 
 
 		 511 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3153  CRISPR-associated protein Cse1 family  45.17 
 
 		 511 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.670831 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3754  CRISPR-associated protein, Cse1 family  42.27 
 
 		 508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0368406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2479  CRISPR-associated protein, Cse1 family  43.95 
 
 		 539 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  40.74 
 
 		 521 aa  369  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2984  CRISPR-associated Cse1 family protein  39.51 
 
 		 529 aa  362  9e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3547  CRISPR-associated Cse1 family protein  41.61 
 
 		 534 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.061728 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00866  CRISPR-associated protein, Cse1 family  40.15 
 
 		 535 aa  342  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.046079  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0227  hypothetical protein  39.11 
 
 		 564 aa  329  8e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0594  hypothetical protein  38.03 
 
 		 528 aa  327  3e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  38.52 
 
 		 534 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.982851 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1380  hypothetical protein  34.67 
 
 		 532 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0528526  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0427  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.46 
 
 		 546 aa  253  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00538764  normal  0.144998 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0864  hypothetical protein  36.05 
 
 		 534 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3315  CRISPR-associated Cse1 family protein  33.72 
 
 		 529 aa  242  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.439764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1813  CRISPR-associated Cse1 family protein  33.33 
 
 		 529 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5414  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.23 
 
 		 560 aa  226  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0174  CRISPR-associated Cse1 family protein  30.73 
 
 		 555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  22.8 
 
 		 502 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  21.28 
 
 		 502 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  21.47 
 
 		 502 aa  87  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1385  hypothetical protein  28.7 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  23.7 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1591  hypothetical protein  22.22 
 
 		 488 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.67 
 
 		 533 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>