211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2804 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  99.57 
 
 		 245 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  99.57 
 
 		 245 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  99.57 
 
 		 245 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  99.57 
 
 		 245 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  100 
 
 		 245 aa  457  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  99.57 
 
 		 245 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  100 
 
 		 245 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2804  branched chain amino acid ABC transporter  100 
 
 		 230 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.1492  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  100 
 
 		 230 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  72.37 
 
 		 248 aa  334  7.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  73.18 
 
 		 257 aa  332  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  73.18 
 
 		 257 aa  332  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  73.18 
 
 		 257 aa  332  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  71.36 
 
 		 237 aa  319  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  72.6 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  71.69 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  70.18 
 
 		 250 aa  301  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  39.46 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  36.74 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0390  AzlC-like protein  39.25 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.709784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  32.76 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4228  hypothetical protein  37.63 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.988743 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  34.05 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  34.05 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  33.51 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  31.33 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1853  AzlC family protein  36.65 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  32.84 
 
 		 282 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  28.26 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  35.36 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  30.18 
 
 		 238 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  29.44 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  32.44 
 
 		 241 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  30.49 
 
 		 229 aa  95.5  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1426  AzlC-like protein  31.39 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000261082  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  27.87 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  31.53 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  31.53 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  31.53 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  29.15 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  31.08 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  31.53 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  30.57 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  29.69 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  30.65 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  31.09 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  31.94 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  30.11 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  29.95 
 
 		 235 aa  88.6  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  29.57 
 
 		 242 aa  88.2  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  29.12 
 
 		 258 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  31.25 
 
 		 307 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  29.06 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3065  AzlC family protein  36.75 
 
 		 237 aa  85.9  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  31.4 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  30.59 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  31.64 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  31.61 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  28.27 
 
 		 246 aa  85.1  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  29.73 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  29.73 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1280  branched chain amino acid efflux pump, LivE family, large subunit  33.17 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.228947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  30.63 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  29.73 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2597  AzlC family protein  26.98 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1105  AzlC-like  31.06 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.316521  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  28.96 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  29.44 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2616  hypothetical protein  32.87 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  32.3 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  29.65 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  29.03 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  29.91 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  30.84 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  28.88 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  27.62 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  28.25 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  29.86 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  26.82 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1542  AzlC family protein  29.36 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.587994  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  31.66 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  26.78 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  26.48 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  31 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  28.42 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  31.79 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  28.76 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1543  AzlC family protein  29.13 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  29.96 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  29.8 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0648  AzlC family protein  25.86 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000031666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  29.55 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  27.62 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  31 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0942  branched-chain amino acid transport protein  30.59 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.147188  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  28.18 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  28.18 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0298  AzlC-like  29.86 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  28.57 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2543  AzlC family protein  31.07 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000104738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>