More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2616 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3912  multidrug resistance protein MdtF  60.84 
 
 
1037 aa  1251  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.149985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2938  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  53.01 
 
 
1041 aa  1036  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  0.0317577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1025  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  58.48 
 
 
1050 aa  1249  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.406583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3817  multidrug resistance protein MdtF  60.84 
 
 
1037 aa  1253  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0885908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2616  aminoglycoside/multidrug efflux system  100 
 
 
1037 aa  2126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.935344  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1835  multidrug efflux transport protein EefB  55.31 
 
 
1035 aa  1121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.99016e-07 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0505  acriflavine resistance protein B  66.05 
 
 
1049 aa  1382  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3154  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  66.05 
 
 
1049 aa  1382  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1207  aminoglycoside/multidrug efflux system  99.71 
 
 
1037 aa  2122  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0440  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  62.5 
 
 
1034 aa  1303  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.875483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0203  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  60.94 
 
 
1037 aa  1254  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.115131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3718  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  55.3 
 
 
1041 aa  1136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3208  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  64.73 
 
 
1050 aa  1355  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.10162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1382  aminoglycoside/multidrug efflux system  79.83 
 
 
1043 aa  1701  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  60.6 
 
 
1049 aa  1256  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.40035  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1336  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  61.72 
 
 
1047 aa  1290  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4428  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  58.77 
 
 
1050 aa  1254  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.391889  normal  0.149359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0284  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.54 
 
 
1052 aa  971  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4473  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.16 
 
 
1052 aa  1000  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.201068  normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0132  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  61.17 
 
 
1045 aa  1281  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14672  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0394  acriflavine resistance protein B  66.05 
 
 
1049 aa  1380  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0890  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  48.41 
 
 
1034 aa  987  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0191734  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3491  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  60.47 
 
 
1052 aa  1272  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.822048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0479  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  60.56 
 
 
1064 aa  1308  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.981936  normal  0.0489217 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0827  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.35 
 
 
1055 aa  965  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2528  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  61.28 
 
 
1066 aa  1293  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.149577 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1544  multidrug efflux protein  50.05 
 
 
1045 aa  1004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3713  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  53.11 
 
 
1058 aa  1089  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135226 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3632  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.62 
 
 
1047 aa  979  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.840793 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0931  multidrug-efflux transporter  47.26 
 
 
1055 aa  970  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6681  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  60.08 
 
 
1063 aa  1242  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0860395  normal  0.0938677 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6464  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  56.39 
 
 
1062 aa  1159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4502  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.42 
 
 
1053 aa  997  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.39279  hitchhiker  0.00639664 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2637  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  61.43 
 
 
1066 aa  1296  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1721  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.13 
 
 
1059 aa  869  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733939 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1599  multidrug efflux protein  49.37 
 
 
1046 aa  983  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.533653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2481  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  53.21 
 
 
1042 aa  1042  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107947  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2428  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.32 
 
 
1043 aa  983  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.164281  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3326  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.77 
 
 
1054 aa  989  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.775486 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4000  multidrug resistance protein MdtF  60.94 
 
 
1037 aa  1254  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3751  acriflavine resistance protein F  62.5 
 
 
1034 aa  1303  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0990355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2749  aminoglycoside/multidrug efflux system  99.52 
 
 
1037 aa  2117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.927319  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0496  acriflavine resistance protein B  66.05 
 
 
1049 aa  1382  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3716  multidrug resistance protein MdtF  60.94 
 
 
1037 aa  1254  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00687785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3459  acriflavine resistance protein F  62.6 
 
 
1034 aa  1305  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0766453  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2599  aminoglycoside/multidrug efflux system  99.52 
 
 
1037 aa  2118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0538  acriflavine resistance protein B  66.05 
 
 
1049 aa  1382  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01756  hypothetical protein  58.92 
 
 
1053 aa  1205  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0531  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  61.75 
 
 
1044 aa  1288  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0606405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3585  RND efflux transporter  55.3 
 
 
1041 aa  1137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3068  acriflavine resistance protein B  64.73 
 
 
1050 aa  1355  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.24086e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1268  aminoglycoside/multidrug efflux system  79.83 
 
 
1043 aa  1701  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1591  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  42.59 
 
 
1040 aa  838  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0568  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  61.11 
 
 
1054 aa  1275  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486962  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0376  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.05 
 
 
1049 aa  874  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433431  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0153  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  61.24 
 
 
1050 aa  1268  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1126  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  65.03 
 
 
1048 aa  1333  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.46715e-06  unclonable  4.81916e-08 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2478  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  55.92 
 
 
1051 aa  1085  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4007  RND efflux transporter  55.2 
 
 
1041 aa  1135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2879  multidrug efflux protein  64.64 
 
 
1050 aa  1353  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.985137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2796  aminoglycoside/multidrug efflux system  79.73 
 
 
1085 aa  1697  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.174051  normal  0.16394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4357  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.41 
 
 
1047 aa  966  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434196  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1615  multidrug efflux protein  49.76 
 
 
1045 aa  1010  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0631699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0689  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  61.37 
 
 
1066 aa  1294  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181022  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5857  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.82 
 
 
1049 aa  942  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5741  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.06 
 
 
1046 aa  1003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194313  normal  0.0197837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3368  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  54.2 
 
 
1065 aa  1128  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0500  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  53.24 
 
 
1051 aa  1082  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4384  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  62.23 
 
 
1044 aa  1310  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2895  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  54.28 
 
 
1059 aa  1173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4060  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  59.81 
 
 
1052 aa  1248  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00709591  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2807  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.73 
 
 
1041 aa  869  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0699119  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3700  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  63.71 
 
 
1033 aa  1314  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3492  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  79.53 
 
 
693 aa  1122  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171899  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4250  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  62.23 
 
 
1044 aa  1310  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1885  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  53.15 
 
 
1041 aa  1092  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.88318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  48.92 
 
 
1050 aa  997  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4832  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  52.41 
 
 
1054 aa  1079  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.921314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51560  multidrug efflux pump RND-family transporter protein  58.42 
 
 
1046 aa  1250  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.793904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01890  Hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  60.44 
 
 
1046 aa  1278  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2326  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  55.35 
 
 
1055 aa  1151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0317  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  51.72 
 
 
1048 aa  1027  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173741  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6028  acriflavin resistance protein B  54.18 
 
 
1044 aa  1085  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5152  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  49.71 
 
 
1055 aa  1040  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3016  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  48.64 
 
 
1056 aa  999  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0546  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  60.99 
 
 
1056 aa  1239  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2163  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.79 
 
 
1078 aa  857  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5496  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  48.45 
 
 
1053 aa  1001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.7814  normal  0.546189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3650  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  48.77 
 
 
1056 aa  990  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1454  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  57.6 
 
 
1049 aa  1133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4211  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  62.23 
 
 
1044 aa  1309  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0505  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  60.13 
 
 
1051 aa  1320  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187639  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3446  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  54.59 
 
 
1036 aa  1087  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.522108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0911  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  52.41 
 
 
1051 aa  1034  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3423  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  54.55 
 
 
1050 aa  1110  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1165  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.48 
 
 
1042 aa  865  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  2.32541e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003894  acridine efflux pump  59.31 
 
 
1053 aa  1210  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4116  aminoglycoside/multidrug efflux system  79.23 
 
 
1036 aa  1698  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3242  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  65.23 
 
 
1042 aa  1354  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0102  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  60.37 
 
 
1051 aa  1286  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>