More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2599 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  98.99 
 
 
395 aa  798  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  97.97 
 
 
395 aa  788  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  98.48 
 
 
395 aa  795  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  100 
 
 
395 aa  801  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2828  ethanolamine utilization protein EutG  87.31 
 
 
395 aa  700  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2606  ethanolamine utilization protein EutG  87.06 
 
 
395 aa  699  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2695  ethanolamine utilization protein EutG  87.31 
 
 
395 aa  700  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2721  ethanolamine utilization protein EutG  87.31 
 
 
395 aa  700  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2654  ethanolamine utilization protein EutG  87.31 
 
 
395 aa  700  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0517138  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2819  ethanolamine utilization protein EutG  97.97 
 
 
395 aa  790  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  98.99 
 
 
395 aa  798  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  98.99 
 
 
395 aa  798  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  98.99 
 
 
395 aa  798  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  98.23 
 
 
395 aa  794  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1237  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.95 
 
 
412 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  39.84 
 
 
382 aa  256  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 
383 aa  254  2e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 
389 aa  253  4e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  40.37 
 
 
382 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  40.05 
 
 
382 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  39.79 
 
 
382 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  40.05 
 
 
382 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  40.11 
 
 
382 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 
383 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  39.52 
 
 
382 aa  247  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  40.05 
 
 
382 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  40.11 
 
 
382 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
382 aa  244  1e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 
387 aa  244  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.4 
 
 
382 aa  243  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  37.4 
 
 
382 aa  242  9e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.19 
 
 
358 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 
383 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.11 
 
 
387 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
384 aa  240  3e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  38.46 
 
 
388 aa  240  3e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 
383 aa  240  3e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  39.95 
 
 
389 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  37.8 
 
 
383 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  36.77 
 
 
383 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
383 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
383 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.64 
 
 
400 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
383 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
383 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
383 aa  239  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
383 aa  239  6e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 
382 aa  239  8e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
382 aa  239  9e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
390 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
400 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
383 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 
395 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 
368 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  36.34 
 
 
381 aa  236  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.89 
 
 
383 aa  236  5e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
398 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.55 
 
 
387 aa  236  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
383 aa  235  1e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
387 aa  235  1e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
390 aa  234  1e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
400 aa  234  2e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  39.25 
 
 
383 aa  234  2e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.41 
 
 
400 aa  234  2e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.11 
 
 
383 aa  234  2e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  39.25 
 
 
382 aa  234  2e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  39.25 
 
 
382 aa  234  2e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.22 
 
 
400 aa  234  2e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.41 
 
 
400 aa  234  2e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  39.25 
 
 
383 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  39.25 
 
 
383 aa  234  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  37.96 
 
 
415 aa  233  4e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  37.96 
 
 
415 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  39.25 
 
 
382 aa  233  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 
387 aa  233  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.72566e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.2 
 
 
383 aa  232  8e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  38.9 
 
 
369 aa  232  8e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.51 
 
 
387 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.67 
 
 
400 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.81233e-05 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 
387 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  3.69007e-07 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
382 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  37.95 
 
 
490 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  38.98 
 
 
383 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 
382 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
383 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  38.98 
 
 
383 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.56 
 
 
637 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 
382 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.67 
 
 
400 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 
388 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 
382 aa  229  9e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
383 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36 
 
 
382 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 
382 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 
382 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.18 
 
 
400 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
392 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
387 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 
382 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 
382 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>