91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2568 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1248  protein of unknown function DUF540  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000124469  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2548  putative sulfate transport protein CysZ  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2700  putative sulfate transport protein CysZ  99.6 
 
 		 253 aa  511  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399677  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02313  putative sulfate transport protein CysZ  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1265  putative sulfate transport protein CysZ  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000198921  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2568  putative sulfate transport protein CysZ  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000943682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2767  putative sulfate transport protein CysZ  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02274  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3644  putative sulfate transport protein CysZ  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000423219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2941  putative sulfate transport protein CysZ  89.33 
 
 		 253 aa  474  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000526268  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2794  putative sulfate transport protein CysZ  89.33 
 
 		 287 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2573  putative sulfate transport protein CysZ  89.33 
 
 		 287 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000546131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2664  putative sulfate transport protein CysZ  89.33 
 
 		 287 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2688  putative sulfate transport protein CysZ  89.33 
 
 		 287 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2622  putative sulfate transport protein CysZ  89.33 
 
 		 287 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00041893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0777  putative sulfate transport protein CysZ  79.67 
 
 		 263 aa  397  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000677117  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1014  putative sulfate transport protein CysZ  78.01 
 
 		 263 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000500888  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2746  putative sulfate transport protein CysZ  79.41 
 
 		 244 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000416155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1319  putative sulfate transport protein CysZ  79.41 
 
 		 244 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.35913e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1430  putative sulfate transport protein CysZ  79.41 
 
 		 244 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000173702  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3189  protein of unknown function DUF540  74.69 
 
 		 256 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000074726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3267  protein of unknown function DUF540  73.95 
 
 		 256 aa  360  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3446  putative sulfate transport protein CysZ  75.4 
 
 		 253 aa  357  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00219453  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2355  putative sulfate transport protein CysZ  63.05 
 
 		 250 aa  342  4e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01310  putative sulfate transport protein CysZ  57.79 
 
 		 249 aa  301  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1513  putative sulfate transport protein CysZ  56.25 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1686  putative sulfate transport protein CysZ  57.08 
 
 		 257 aa  291  5e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0490  putative sulfate transport protein CysZ  54.88 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000555073  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2464  putative sulfate transport protein CysZ  52.21 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2517  putative sulfate transport protein CysZ  52.61 
 
 		 257 aa  285  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.160746  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1734  putative sulfate transport protein CysZ  52.61 
 
 		 257 aa  279  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  hitchhiker  0.00000000137908 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004155  sulfate transporter CysZ-type  57.59 
 
 		 228 aa  276  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000767256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3468  putative sulfate transport protein CysZ  50.61 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2380  putative sulfate transport protein CysZ  53.01 
 
 		 257 aa  271  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0944134  hitchhiker  0.000158699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1702  putative sulfate transport protein CysZ  53.94 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000296404  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2682  putative sulfate transport protein CysZ  53.94 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000538475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2761  putative sulfate transport protein CysZ  53.94 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00115668  hitchhiker  0.0000596308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2657  putative sulfate transport protein CysZ  53.53 
 
 		 259 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131365  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1505  putative sulfate transport protein CysZ  52.82 
 
 		 259 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000542518  hitchhiker  0.0000000567341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1572  putative sulfate transport protein CysZ  52.82 
 
 		 259 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000851255  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1566  putative sulfate transport protein CysZ  52.82 
 
 		 259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000261033  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2899  putative sulfate transport protein CysZ  52.87 
 
 		 259 aa  265  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2850  putative sulfate transport protein CysZ  52.08 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2367  putative sulfate transport protein CysZ  51.61 
 
 		 259 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2339  hypothetical protein  51.42 
 
 		 263 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.747358  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01847  putative sulfate transport protein CysZ  51.48 
 
 		 245 aa  255  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1773  hypothetical protein  53.56 
 
 		 244 aa  254  9e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0370  putative sulfate transport protein CysZ  51.48 
 
 		 257 aa  245  4e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0886  putative sulfate transport protein CysZ  45.23 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1015  putative sulfate transport protein CysZ  43.57 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1177  cysZ protein  43.15 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3616  hypothetical protein  47.01 
 
 		 249 aa  191  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4674  putative sulfate transport protein CysZ  43.51 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53330  putative sulfate transport protein CysZ  43.51 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.442824 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2227  protein of unknown function DUF540  44.21 
 
 		 241 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3262  hypothetical protein  44.86 
 
 		 242 aa  185  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0899601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0976  putative sulfate transport protein CysZ  44.81 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828685  normal  0.13166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4409  putative sulfate transport protein CysZ  44.17 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.285932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0819  putative sulfate transport protein CysZ  45.42 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0808  putative sulfate transport protein CysZ  45.92 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00684995  normal  0.0715554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0785  putative sulfate transport protein CysZ  45.49 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0197776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4403  hypothetical protein  42.26 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1834  putative sulfate transport protein CysZ  42.56 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.724541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2474  hypothetical protein  36.25 
 
 		 250 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030274  normal  0.489953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10220  putative sulfate transport protein CysZ  45.66 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3197  putative sulfate uptake protein  34.39 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.155979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1699  hypothetical protein  39.92 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.195825  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2030  protein of unknown function DUF540  39.33 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1712  putative sulfate transport protein CysZ  33.33 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1581  protein of unknown function DUF540  34.47 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.768375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0890  hypothetical protein  25.9 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4416  hypothetical protein  25.21 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.921944  normal  0.0304901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2099  protein of unknown function DUF540  28.79 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000514107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5501  protein of unknown function DUF540  26.19 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000395042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0416  protein of unknown function DUF540  23.89 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.881692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1024  CysZ protein  28.82 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000955852  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1157  protein of unknown function DUF540  26.57 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.377801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21450  uncharacterized protein involved in cysteine biosynthesis  30.17 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.412828 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1126  protein of unknown function DUF540  26.09 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2442  hypothetical protein  31.31 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0221132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4000  protein of unknown function DUF540  25.47 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3441  hypothetical protein  25.75 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0964499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7196  putative sulfate transport protein CysZ  26.58 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5770  hypothetical protein  24.14 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0384  hypothetical protein  27.97 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0322  hypothetical protein  32.93 
 
 		 302 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0202  protein of unknown function DUF540  25.84 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0194  protein of unknown function DUF540  25.32 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0634  putative integral membrane protein  27.14 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.12816  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  25.25 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1193  protein of unknown function DUF540  22.31 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.436714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>