116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2565 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2770  sodium:bile acid symporter family protein  99.1 
 
 
332 aa  661  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.64758e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3641  sodium:bile acid symporter family protein  99.4 
 
 
332 aa  662  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.61961e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2565  bile acid/Na+ symporter family protein  100 
 
 
332 aa  667  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  8.97855e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1269  bile acid:sodium symporter  99.1 
 
 
332 aa  660  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  9.08139e-08  hitchhiker  0.000128844 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2697  bile acid/Na+ symporter family protein  99.1 
 
 
332 aa  661  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.09356e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2544  bile acid/Na+ symporter family protein  99.1 
 
 
332 aa  660  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.83747e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1252  Bile acid:sodium symporter  99.1 
 
 
332 aa  660  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000190028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02309  predicted inner membrane protein  99.1 
 
 
332 aa  660  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  8.32535e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02270  hypothetical protein  99.1 
 
 
332 aa  660  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  8.38069e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2660  transporter bile acid/Na+ symporter family  90.96 
 
 
332 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2618  bile acid/Na+ symporter family protein  91.27 
 
 
332 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2569  transporter, bile acid/Na+ symporter family  90.96 
 
 
332 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000515206  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2684  bile acid/Na+ symporter family transporter  90.36 
 
 
332 aa  583  1e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68374  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2790  bile acid/Na+ symporter family transporter  90.66 
 
 
332 aa  582  1e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2937  bile acid:sodium symporter  88.86 
 
 
331 aa  567  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.120648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3442  bile acid:sodium symporter  79.15 
 
 
330 aa  447  1e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176045  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1906  Bile acid:sodium symporter  65.84 
 
 
331 aa  405  1e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2144  Bile acid:sodium symporter  67.73 
 
 
333 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2034  Bile acid:sodium symporter  67.82 
 
 
330 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2334  Bile acid:sodium symporter  65.63 
 
 
329 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.87771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2250  hypothetical protein  65.94 
 
 
332 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  2.288e-05 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2484  bile acid:sodium symporter  56.7 
 
 
331 aa  364  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.846841  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3262  hypothetical protein  59.38 
 
 
333 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2266  putative sodium/bile acid symporter family protein  65.62 
 
 
342 aa  360  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1994  hypothetical protein  65.31 
 
 
342 aa  359  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1880  putative sodium/bile acid symporter family protein  65 
 
 
342 aa  358  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38320  bile acid/Na+ symporter family transporter  61.76 
 
 
333 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2738  hypothetical protein  58.82 
 
 
329 aa  346  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.889143  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3402  hypothetical protein  58.82 
 
 
329 aa  345  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431314  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3465  bile acid:sodium symporter  55.42 
 
 
348 aa  346  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.440703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3177  bile acid:sodium symporter  57.94 
 
 
347 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.98524  normal  0.0121029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2904  bile acid:sodium symporter  60.3 
 
 
334 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.731183  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0112  hypothetical protein  52.62 
 
 
328 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0657186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3255  bile acid:sodium symporter  61.61 
 
 
332 aa  338  6e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3619  Bile acid:sodium symporter  54.37 
 
 
344 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3320  Bile acid:sodium symporter  54.06 
 
 
334 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2501  bile acid:sodium symporter  57.79 
 
 
324 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4465  bile acid:sodium symporter  59.82 
 
 
333 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2382  bile acid:sodium symporter  59.46 
 
 
330 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2877  bile acid/Na+ symporter family protein  59.94 
 
 
333 aa  329  5e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04030  bile acid/sodium symporter  52.15 
 
 
334 aa  328  6e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0532  sodium/bile acid symporter family protein  56.56 
 
 
382 aa  327  1e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0352  sodium/bile acid symporter family protein  54.38 
 
 
346 aa  328  1e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2812  bile acid:sodium symporter  59.64 
 
 
333 aa  327  1e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.885659  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2029  sodium/bile acid symporter family protein  56.56 
 
 
346 aa  327  2e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0339  sodium/bile acid symporter family protein  56.56 
 
 
346 aa  327  2e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3064  sodium/bile acid symporter family protein  56.56 
 
 
346 aa  327  2e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2255  sodium/bile acid symporter family protein  56.56 
 
 
346 aa  327  2e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3390  sodium/bile acid symporter family protein  56.56 
 
 
346 aa  327  2e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2714  bile acid:sodium symporter  53.48 
 
 
331 aa  319  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.476045  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0302  sodium/bile acid symporter family protein  54.65 
 
 
394 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5029  hypothetical protein  52.2 
 
 
330 aa  313  3e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2148  bile acid:sodium symporter  54.18 
 
 
344 aa  313  3e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0247  bile acid:sodium symporter  52.22 
 
 
324 aa  312  4e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2965  bile acid:sodium symporter  54.88 
 
 
343 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4282  putative sodium/bile acid symporter family protein  56.1 
 
 
342 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0321  Bile acid:sodium symporter  55.1 
 
 
323 aa  307  2e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.15131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0152  bile acid:sodium symporter  55.83 
 
 
340 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2880  bile acid:sodium symporter  54.74 
 
 
347 aa  305  9e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2970  bile acid:sodium symporter  54.13 
 
 
343 aa  304  1e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2356  bile acid:sodium symporter  54.13 
 
 
343 aa  304  1e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1029  sodium/bile acid symporter family protein  54.31 
 
 
321 aa  303  3e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1064  sodium/bile acid symporter family protein  54.31 
 
 
321 aa  303  3e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6319  bile acid/sodium symporter  54.24 
 
 
343 aa  303  4e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0427  Bile acid:sodium symporter  57.1 
 
 
342 aa  303  4e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3017  bile acid:sodium symporter  54.13 
 
 
347 aa  303  4e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2990  bile acid:sodium symporter  55.97 
 
 
343 aa  302  5e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3716  Bile acid:sodium symporter  50.64 
 
 
343 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0440669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4937  Bile acid:sodium symporter  48.62 
 
 
335 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0866  bile acid:sodium symporter  48.38 
 
 
339 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.299881 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0139  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  285  6e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0527  hypothetical protein  45.03 
 
 
363 aa  284  2e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  5.23356e-05 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0326  Bile acid:sodium symporter  44.17 
 
 
325 aa  280  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0453748 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2407  Bile acid:sodium symporter  45.65 
 
 
343 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195437  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2813  Bile acid:sodium symporter  46.41 
 
 
343 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1364  hypothetical protein  43.49 
 
 
340 aa  274  2e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.953103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0525  bile acid:sodium symporter  48.24 
 
 
336 aa  272  5e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0585  lipoprotein transmembrane  43.98 
 
 
341 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1098  bile acid:sodium symporter  46.96 
 
 
336 aa  269  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.981697  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4216  Bile acid:sodium symporter  48.4 
 
 
329 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2538  lipoprotein transmembrane  45.81 
 
 
358 aa  265  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4831  putative symporter family protein  47.15 
 
 
332 aa  254  1e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2484  bile acid:sodium symporter  44.03 
 
 
328 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284228  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17200  predicted Na+-dependent transporter  47.22 
 
 
328 aa  250  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4204  bile acid:sodium symporter  46.34 
 
 
330 aa  245  1e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0807  Bile acid:sodium symporter  42.94 
 
 
357 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.308554 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4379  bile acid:sodium symporter  43.13 
 
 
322 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2649  bile acid:sodium symporter  49.83 
 
 
335 aa  234  2e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3572  hypothetical protein  51.64 
 
 
328 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2427  bile acid:sodium symporter  40.56 
 
 
335 aa  229  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574524  normal  0.0414588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3613  bile acid:sodium symporter  40.24 
 
 
338 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423949  hitchhiker  0.00964207 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3818  bile acid:sodium symporter  40.81 
 
 
332 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.530909  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3205  Bile acid:sodium symporter  40.82 
 
 
328 aa  217  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  2.45995e-06 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1125  Bile acid:sodium symporter  38.34 
 
 
341 aa  211  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2181  bile acid:sodium symporter  38.01 
 
 
323 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2103  Bile acid:sodium symporter  36.68 
 
 
348 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0648  transporter, putative  39.56 
 
 
342 aa  201  1e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4668  Na+-dependent transporter-like protein  39.12 
 
 
337 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1861  hypothetical protein  39.88 
 
 
332 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0440026  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0747  transporter, putative  38.72 
 
 
342 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>