More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2052 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  97.01 
 
 
401 aa  770    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  94.28 
 
 
402 aa  743    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  94.03 
 
 
402 aa  739    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  95.02 
 
 
402 aa  749    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  83.7 
 
 
404 aa  660    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  87.59 
 
 
403 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  97.51 
 
 
401 aa  775    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
401 aa  795    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  95.02 
 
 
402 aa  749    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  97.01 
 
 
401 aa  770    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  88.59 
 
 
403 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  88.59 
 
 
403 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  87.59 
 
 
403 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  87.59 
 
 
403 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  61.45 
 
 
428 aa  500  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  61.45 
 
 
428 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  61.45 
 
 
428 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  64.32 
 
 
407 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  61.18 
 
 
405 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  59.6 
 
 
399 aa  464  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  59.71 
 
 
405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  58.48 
 
 
405 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01080  hypothetical protein  97.26 
 
 
219 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  49.27 
 
 
404 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  47.43 
 
 
415 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  45.18 
 
 
417 aa  315  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  45.39 
 
 
401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  46.63 
 
 
383 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  46.36 
 
 
402 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  46.36 
 
 
402 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  44.01 
 
 
405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  41.84 
 
 
420 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  43.93 
 
 
401 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  43.71 
 
 
410 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  45.87 
 
 
406 aa  292  9e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  41.43 
 
 
442 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  44.37 
 
 
423 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  43.46 
 
 
387 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  41.71 
 
 
425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  40.75 
 
 
414 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  40.71 
 
 
414 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  40.71 
 
 
414 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  40.76 
 
 
413 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  40.71 
 
 
414 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  41.61 
 
 
413 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  41.61 
 
 
413 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  41.61 
 
 
413 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  41.61 
 
 
413 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  41.61 
 
 
413 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  41.61 
 
 
413 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  41.61 
 
 
413 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  41.11 
 
 
410 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  41.11 
 
 
426 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  41 
 
 
413 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  41 
 
 
413 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  41 
 
 
413 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  39.9 
 
 
413 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  40.76 
 
 
413 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  39.62 
 
 
414 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  40.05 
 
 
413 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  40.34 
 
 
400 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  40.1 
 
 
400 aa  255  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  38.06 
 
 
442 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.09 
 
 
430 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  41.63 
 
 
404 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  38.98 
 
 
408 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  39.24 
 
 
440 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  39.5 
 
 
440 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  39.8 
 
 
399 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  36.09 
 
 
450 aa  245  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  38.57 
 
 
441 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  36.98 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.81 
 
 
395 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.55 
 
 
435 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  38.56 
 
 
398 aa  242  9e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  39.95 
 
 
402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  35.55 
 
 
462 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  35.33 
 
 
462 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  39.47 
 
 
402 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  39.72 
 
 
413 aa  237  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.36 
 
 
418 aa  236  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  38.34 
 
 
443 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  40.49 
 
 
395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  38.97 
 
 
425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  39.22 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  36.54 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  37.53 
 
 
407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  37.65 
 
 
407 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  37.65 
 
 
407 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  36.57 
 
 
438 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  39.85 
 
 
395 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  37.68 
 
 
398 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  37.97 
 
 
418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  38.02 
 
 
398 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.33 
 
 
428 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.8 
 
 
428 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  36.23 
 
 
395 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  36.72 
 
 
395 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  35 
 
 
419 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  34.37 
 
 
419 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>