99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2016 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  362  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  99.44 
 
 
179 aa  360  8e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  99.44 
 
 
179 aa  360  8e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  99.44 
 
 
179 aa  360  8e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  99.44 
 
 
179 aa  360  8e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  7.5989e-05 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  99.44 
 
 
179 aa  360  8e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  99.44 
 
 
179 aa  360  8e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  99.44 
 
 
179 aa  360  8e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  98.88 
 
 
179 aa  358  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  94.94 
 
 
179 aa  322  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60311e-08 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  94.94 
 
 
179 aa  322  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  94.94 
 
 
179 aa  322  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  94.94 
 
 
179 aa  322  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.89224e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  94.38 
 
 
179 aa  321  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3622e-05 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  93.71 
 
 
175 aa  311  2e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  84.66 
 
 
178 aa  287  5e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  76.7 
 
 
179 aa  279  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  83.71 
 
 
179 aa  269  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  82.95 
 
 
179 aa  269  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  80.34 
 
 
179 aa  263  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  80.34 
 
 
179 aa  263  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  82.58 
 
 
179 aa  263  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  79.78 
 
 
179 aa  262  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  57.14 
 
 
180 aa  199  2e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1294  hypothetical protein  56.82 
 
 
182 aa  196  1e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14660  hypothetical protein  56.82 
 
 
182 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0837  hypothetical protein  57.95 
 
 
180 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  57.14 
 
 
179 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0867  hypothetical protein  57.56 
 
 
176 aa  187  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430194  normal  0.573966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4341  hypothetical protein  56.65 
 
 
177 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.4665  hitchhiker  4.05508e-08 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0880  hypothetical protein  56.98 
 
 
176 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0587539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  54.55 
 
 
182 aa  184  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1417  hypothetical protein  54.86 
 
 
179 aa  181  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0102  hypothetical protein  47.16 
 
 
178 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1533  hypothetical protein  50.29 
 
 
181 aa  137  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  42.47 
 
 
263 aa  93.2  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  39.6 
 
 
175 aa  91.3  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06571  hypothetical protein  37.35 
 
 
172 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  35.62 
 
 
257 aa  89.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  30.32 
 
 
257 aa  87.4  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000695  hypothetical protein  36.14 
 
 
172 aa  85.5  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.86494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  39.55 
 
 
177 aa  81.3  7e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2356  putative outer membrane lipoprotein  34.81 
 
 
190 aa  70.9  9e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.662558  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  47.22 
 
 
156 aa  63.5  2e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.41658e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  35.61 
 
 
158 aa  61.6  5e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  1.08744e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  45.83 
 
 
156 aa  61.2  8e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  45.83 
 
 
156 aa  60.8  9e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.72178e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  45.83 
 
 
156 aa  60.8  9e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.63697e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1384  17 kDa surface antigen  31.62 
 
 
376 aa  60.8  9e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  45.83 
 
 
147 aa  60.8  1e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  7.3012e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1170  17 kDa surface antigen  51.25 
 
 
120 aa  60.1  2e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2507  17 kDa surface antigen  36.42 
 
 
171 aa  59.7  2e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.424442  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  38.4 
 
 
158 aa  58.5  5e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  53.45 
 
 
215 aa  58.5  5e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  34.85 
 
 
155 aa  58.5  5e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.76746e-05  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  53.45 
 
 
216 aa  58.5  5e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  53.45 
 
 
215 aa  58.5  5e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  51.72 
 
 
216 aa  57.8  9e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  51.72 
 
 
204 aa  56.2  2e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3376  17 kDa surface antigen  35.56 
 
 
214 aa  56.2  2e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  51.72 
 
 
272 aa  56.2  2e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1954  17 kDa surface antigen  33.57 
 
 
206 aa  55.8  3e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000188726  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  61.9 
 
 
206 aa  56.2  3e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  49.21 
 
 
160 aa  56.2  3e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.3242e-06  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0378  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 
217 aa  55.8  3e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  37.37 
 
 
189 aa  54.7  7e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  50 
 
 
218 aa  54.3  1e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  50 
 
 
218 aa  54.3  1e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  61.9 
 
 
217 aa  53.9  1e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  40.28 
 
 
164 aa  54.3  1e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  5.36943e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  50 
 
 
208 aa  54.3  1e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3351  histidine kinase  30.77 
 
 
185 aa  53.9  1e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  3.6604e-05  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  50 
 
 
218 aa  54.3  1e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  50 
 
 
218 aa  54.3  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  50 
 
 
218 aa  54.3  1e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  50 
 
 
218 aa  54.3  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  50 
 
 
218 aa  54.3  1e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  49.15 
 
 
165 aa  52.8  3e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  34.82 
 
 
165 aa  52.8  3e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1883  17 kDa surface antigen  45.76 
 
 
156 aa  51.2  8e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.19533e-08  hitchhiker  0.00180975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2581  17 kDa surface antigen  45.76 
 
 
156 aa  51.2  8e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.85697e-08  normal  0.0842318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2461  17 kDa surface antigen  45.76 
 
 
156 aa  51.2  8e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  8.26442e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2643  17 kDa surface antigen  38.26 
 
 
280 aa  50.4  1e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.796605  normal  0.311018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2223  17 kDa surface antigen  44.07 
 
 
156 aa  50.4  1e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  6.54513e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1858  17 kDa surface antigen  38.19 
 
 
223 aa  49.7  2e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.699281  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1570  17 kDa surface antigen  46.67 
 
 
163 aa  48.9  3e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.17711e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1639  17 kDa surface antigen  32.68 
 
 
171 aa  47.8  9e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  44 
 
 
225 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2250  17 kDa surface antigen  41.67 
 
 
164 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  4.54882e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1601  17 kDa surface antigen  33.58 
 
 
234 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  52.27 
 
 
146 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2741  17 kDa surface antigen  28.1 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.29195  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  38 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04299  17 kDa surface antigen family protein  48.57 
 
 
126 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2231  17 kDa surface antigen  28.1 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.302899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4774  17 kDa surface antigen  32.79 
 
 
213 aa  42  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0665442 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003952  outer membrane lipoprotein  38.6 
 
 
158 aa  42  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0034992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1086  17 kDa surface antigen  32.06 
 
 
238 aa  42  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  58.14 
 
 
167 aa  41.2  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>