191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1973 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1329  septum formation inhibitor  100 
 
 
236 aa  477  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000408843  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01151  septum formation inhibitor  99.57 
 
 
231 aa  474  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2472  septum site-determining protein MinC  99.57 
 
 
231 aa  474  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000733034  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1661  septum formation inhibitor  100 
 
 
231 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000772871  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1973  septum formation inhibitor  100 
 
 
231 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000684881  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01161  hypothetical protein  99.57 
 
 
231 aa  474  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0900971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1276  septum formation inhibitor  99.57 
 
 
236 aa  475  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1320  septum formation inhibitor  100 
 
 
231 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000146927  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2449  septum formation inhibitor  99.57 
 
 
231 aa  474  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00348167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1319  septum formation inhibitor  83.83 
 
 
235 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000246885  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1503  septum formation inhibitor  83.83 
 
 
235 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00645654  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1956  septum formation inhibitor  83.83 
 
 
235 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000234823  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2013  septum formation inhibitor  83.83 
 
 
235 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal  0.267553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1952  septum formation inhibitor  83.83 
 
 
235 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00224738  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2371  septum formation inhibitor  79.57 
 
 
235 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000657693  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2121  septum formation inhibitor  64.94 
 
 
228 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000192978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2010  septum formation inhibitor  64.94 
 
 
228 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596174  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2399  septum formation inhibitor  64.94 
 
 
228 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1997  septum formation inhibitor  66.09 
 
 
232 aa  312  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000933113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2756  septum formation inhibitor  63.75 
 
 
233 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000039542  hitchhiker  0.00154059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1940  septum formation inhibitor  63.09 
 
 
228 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2236  septum formation inhibitor  63.09 
 
 
228 aa  299  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000399265  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2006  septum formation inhibitor  61.8 
 
 
225 aa  294  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406679  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0444  septum formation inhibitor  55.27 
 
 
231 aa  267  1e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.66341  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1545  septum formation inhibitor  48.48 
 
 
220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000716221  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01386  septum formation inhibitor  45.02 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004086  septum site-determining protein MinC  44.35 
 
 
220 aa  207  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000371161  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1067  septum formation inhibitor  43.36 
 
 
221 aa  201  6e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00667924  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2184  septum formation inhibitor  39.66 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  unclonable  0.00000164505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1868  septum formation inhibitor  39.39 
 
 
221 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1895  septum formation inhibitor  39.39 
 
 
221 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000124722  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2424  septum formation inhibitor  39.39 
 
 
221 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000361193  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2519  septum formation inhibitor  40.69 
 
 
221 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000141313  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1902  septum formation inhibitor  39.39 
 
 
221 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000746493  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2581  septum formation inhibitor  38.91 
 
 
239 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150935  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2382  septum formation inhibitor  38.96 
 
 
221 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2576  septum formation inhibitor  38.53 
 
 
221 aa  165  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2173  septum formation inhibitor  38.96 
 
 
221 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000273215  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2250  septum formation inhibitor  38.96 
 
 
221 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000125523  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3066  septum site-determining protein MinC  40.34 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1765  septum formation inhibitor  38.1 
 
 
221 aa  162  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1737  septum formation inhibitor  37.23 
 
 
221 aa  162  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2444  septum formation inhibitor  39.39 
 
 
236 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000352986  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1930  septum formation inhibitor  40.34 
 
 
224 aa  158  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000656846  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2114  septum formation inhibitor  37.66 
 
 
221 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000440493  normal  0.228236 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1998  septum site-determining protein MinC  41.63 
 
 
241 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.256846  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0275  septum site-determining protein MinC  37.9 
 
 
277 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.798079 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1077  septum site-determining protein MinC  35.81 
 
 
233 aa  152  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00582076  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0508  septum formation inhibitor MinC  38.11 
 
 
244 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1629  septum formation inhibitor  36.8 
 
 
221 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000164279  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0598  septum formation inhibitor  39.34 
 
 
238 aa  149  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2354  septum site-determining protein MinC  37.4 
 
 
241 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186227  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0680  septum formation inhibitor  39.34 
 
 
238 aa  149  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3872  septum site-determining protein MinC  38.79 
 
 
246 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1613  septum formation inhibitor  38.79 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35110  septum formation inhibitor  37.08 
 
 
238 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1235  septum formation inhibitor  37.61 
 
 
242 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0560003  normal  0.567033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1284  septum formation inhibitor  36.55 
 
 
248 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1882  septum formation inhibitor  36.14 
 
 
263 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22040  septum formation inhibitor  37.7 
 
 
263 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517212  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1695  septum formation inhibitor  38.53 
 
 
245 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337254  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0014  septum site-determining protein MinC  37.71 
 
 
243 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.062849 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0925  septum site-determining protein MinC  36.2 
 
 
243 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00858984  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2335  septum formation inhibitor  36.67 
 
 
249 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.782568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1734  septum formation inhibitor  36.4 
 
 
275 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1326  septum formation inhibitor  36.82 
 
 
253 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3985  septum formation inhibitor  35.68 
 
 
255 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1510  hypothetical protein  38.3 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1591  septum site-determining protein MinC  34.65 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153495  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3027  septum site-determining protein MinC  36.09 
 
 
242 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218288  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0013  septum site-determining protein MinC  37.83 
 
 
227 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.838268  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1473  hypothetical protein  37.87 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01604  septum site-determining protein MinC  31.91 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00110922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1838  septum site-determining protein MinC  37.5 
 
 
259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3341  septum site-determining protein MinC  34.8 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0319  septum formation inhibitor  33.47 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1164  septum site-determining protein MinC  34.67 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0965  septum formation inhibitor  36.14 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0065  septum site-determining protein MinC  32.68 
 
 
255 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0084  septum site-determining protein MinC  32.68 
 
 
255 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3345  septum site-determining protein MinC  32.56 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23046  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1936  septum site-determining protein MinC  35 
 
 
242 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4713  septum site-determining protein MinC  33.76 
 
 
248 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0342769  decreased coverage  0.00921136 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04463  septum formation inhibitor  33.03 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1096  septum formation inhibitor  31.62 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0032  septum site-determining protein MinC  33.07 
 
 
263 aa  118  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.410574 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1569  septum formation inhibitor  32.2 
 
 
271 aa  118  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1632  septum site-determining protein MinC  34.98 
 
 
251 aa  118  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0943  septum formation inhibitor  32.55 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0504  septum formation inhibitor  32.16 
 
 
261 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.694203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0983  septum formation inhibitor  32.16 
 
 
261 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0655  septum formation inhibitor  51.22 
 
 
282 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0009  septum site-determining protein MinC  33.62 
 
 
256 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.274749 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0321  septum formation inhibitor  31.97 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6586  septum formation inhibitor  32.19 
 
 
239 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249532 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3067  septum formation inhibitor  47.66 
 
 
270 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2968  septum formation inhibitor  47.66 
 
 
270 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3033  septum formation inhibitor  47.66 
 
 
270 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1992  septum formation inhibitor  35.02 
 
 
282 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4087  septum formation inhibitor  32.27 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.379648  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>