More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1834 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1834  multidrug efflux outer membrane protein EefC  100 
 
 
457 aa  921    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000044393 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1929  multidrug efflux outer membrane protein EefC  98.47 
 
 
457 aa  907    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  54.17 
 
 
465 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2477  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.27 
 
 
484 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  53 
 
 
468 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3584  outer membrane protein oprM  53 
 
 
468 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4008  outer membrane protein oprM  53.22 
 
 
468 aa  444  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3798  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.98 
 
 
462 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1884  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.27 
 
 
464 aa  375  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0017284  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.51 
 
 
486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.49 
 
 
470 aa  353  5e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.06 
 
 
484 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  42.86 
 
 
486 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.37 
 
 
474 aa  350  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.94 
 
 
484 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3836  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.85 
 
 
471 aa  348  9e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232227  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.72 
 
 
484 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.72 
 
 
484 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.98 
 
 
486 aa  347  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  43.19 
 
 
485 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  42.98 
 
 
485 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1337  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.1 
 
 
471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3369  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.01 
 
 
489 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413443  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.83 
 
 
474 aa  340  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  40.56 
 
 
512 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.36 
 
 
478 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  44.26 
 
 
491 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.43 
 
 
517 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.38 
 
 
492 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 
477 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.7 
 
 
472 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.54 
 
 
500 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  39.87 
 
 
499 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.48 
 
 
470 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.77 
 
 
489 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.46 
 
 
474 aa  326  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2869  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.21 
 
 
480 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451085  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3841  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.58 
 
 
490 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626052  normal  0.467321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2327  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.52 
 
 
528 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.356993  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.09 
 
 
501 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2838  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.31 
 
 
528 aa  323  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.207275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2864  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.61 
 
 
468 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0383351  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.34 
 
 
499 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.92 
 
 
467 aa  319  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296212  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.57 
 
 
477 aa  319  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 
475 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.24 
 
 
516 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1416  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  40.31 
 
 
469 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  41.27 
 
 
487 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  39.18 
 
 
474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5965  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.26 
 
 
475 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5601  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.26 
 
 
475 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2110  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.41 
 
 
520 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277325  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.73 
 
 
482 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1737  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  40.13 
 
 
497 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746142  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6465  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.38 
 
 
475 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0283455 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.18 
 
 
525 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.33 
 
 
505 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.17 
 
 
510 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2896  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.11 
 
 
477 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.4 
 
 
507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.6 
 
 
546 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51570  multidrug efflux pump RND-family outer membrane protein  37.87 
 
 
505 aa  303  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0329698  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.4 
 
 
507 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0403  outer membrane protein OprM  39.83 
 
 
485 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102824 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3678  outer membrane efflux protein  37.8 
 
 
469 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0849669  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.19 
 
 
507 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6990  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.18 
 
 
479 aa  300  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0598431  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.79 
 
 
507 aa  299  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.71 
 
 
480 aa  299  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.41 
 
 
496 aa  299  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3466  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.41 
 
 
461 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0383  outer membrane protein OprM  39.61 
 
 
485 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.14 
 
 
515 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0443  outer membrane efflux protein OprA  39.61 
 
 
485 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.340499  hitchhiker  0.0000000156404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0381  outer membrane protein OprM  39.61 
 
 
485 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119096 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0775  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.35 
 
 
476 aa  296  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0389  outer membrane protein OprM  38.96 
 
 
485 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.303382  hitchhiker  0.0000297498 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2544  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.27 
 
 
467 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109213  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2607  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.97 
 
 
507 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1997  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.97 
 
 
507 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0794932  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.26 
 
 
503 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.76 
 
 
507 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.74 
 
 
485 aa  293  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.8 
 
 
483 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.16 
 
 
469 aa  292  7e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1905  outer membrane efflux protein OprA  38.05 
 
 
516 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2059  Outer membrane efflux protein  38.05 
 
 
513 aa  292  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26387  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.31 
 
 
485 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1624  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.4 
 
 
486 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1660  hypothetical protein  38.05 
 
 
516 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.077421  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.4 
 
 
486 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.804634  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.78 
 
 
508 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229467  normal  0.0582449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1154  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.78 
 
 
501 aa  291  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.039626  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6206  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.22 
 
 
508 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00238233 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5839  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.22 
 
 
508 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2819  outer membrane protein OprJ  39.35 
 
 
468 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.64 
 
 
481 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.61 
 
 
495 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.18 
 
 
485 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.355658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>