More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1804 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  99.72 
 
 
360 aa  746    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  99.72 
 
 
360 aa  746    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  99.44 
 
 
360 aa  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
360 aa  747    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  99.17 
 
 
360 aa  741    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  99.44 
 
 
360 aa  743    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  99.72 
 
 
360 aa  746    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  82.5 
 
 
585 aa  612  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  66.3 
 
 
370 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  67.12 
 
 
370 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  64.48 
 
 
366 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  64.48 
 
 
366 aa  481  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  64.48 
 
 
366 aa  481  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  64.21 
 
 
366 aa  482  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  64.48 
 
 
366 aa  481  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  64.75 
 
 
366 aa  484  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  64.48 
 
 
366 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  62.74 
 
 
367 aa  478  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  64.21 
 
 
366 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  64.21 
 
 
366 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  64.48 
 
 
366 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  63.93 
 
 
366 aa  478  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  62.74 
 
 
367 aa  477  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  61.92 
 
 
367 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  60.83 
 
 
365 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  60.83 
 
 
365 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  61.96 
 
 
374 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  60.43 
 
 
384 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  61.14 
 
 
369 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  60.6 
 
 
369 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.29 
 
 
377 aa  425  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  59.78 
 
 
367 aa  425  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  57.34 
 
 
370 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  57.64 
 
 
378 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  58.24 
 
 
363 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  57.34 
 
 
369 aa  414  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  58.11 
 
 
370 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2796  ABC transporter related  56.79 
 
 
338 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.854812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  56.45 
 
 
372 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  56.51 
 
 
366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  54.96 
 
 
371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  56.49 
 
 
370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  56.38 
 
 
377 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  55.71 
 
 
367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  53.7 
 
 
371 aa  398  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  55.19 
 
 
364 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  54.22 
 
 
366 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  53.41 
 
 
402 aa  398  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  55.53 
 
 
367 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  55.53 
 
 
367 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  56.22 
 
 
372 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  56.49 
 
 
370 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0907  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.37 
 
 
375 aa  391  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0858146  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  54.59 
 
 
367 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  55.76 
 
 
369 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  52.8 
 
 
376 aa  388  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  53.12 
 
 
367 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  53.93 
 
 
367 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  53.91 
 
 
373 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  53.91 
 
 
368 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  54.79 
 
 
402 aa  385  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  54.96 
 
 
369 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.28 
 
 
369 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  53.21 
 
 
380 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  49.88 
 
 
426 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  52.63 
 
 
360 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  53.28 
 
 
363 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  55.38 
 
 
365 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0607  ABC transporter related  52.79 
 
 
397 aa  372  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0567231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  53.37 
 
 
392 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  53.42 
 
 
365 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  53.85 
 
 
369 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.22 
 
 
370 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.4 
 
 
357 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 
370 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 
370 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 
370 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 
388 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 
370 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  52.37 
 
 
369 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.56 
 
 
357 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.92 
 
 
363 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
370 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  52.96 
 
 
369 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  49.13 
 
 
404 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  53.41 
 
 
364 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  52.68 
 
 
369 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  50.55 
 
 
374 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  53.41 
 
 
364 aa  364  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  52.38 
 
 
369 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  52.68 
 
 
368 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  51.81 
 
 
369 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  53.13 
 
 
364 aa  363  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  52.68 
 
 
368 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  47.73 
 
 
398 aa  363  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  52.62 
 
 
381 aa  363  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.56 
 
 
357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  54.21 
 
 
361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  53.33 
 
 
353 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.54 
 
 
359 aa  361  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>