More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1766 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2239  aldo/keto reductase  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0140454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2252  putative oxidoreductase  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1766  putative oxidoreductase  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951362 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1489  putative oxidoreductase  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1587  putative oxidoreductase  99.3 
 
 		 286 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2008  putative oxidoreductase  98.95 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.865157  normal  0.493035 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3959  putative oxidoreductase  75.71 
 
 		 290 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102223 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3561  putative oxidoreductase  75.71 
 
 		 292 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6342  putative oxidoreductase  76.6 
 
 		 291 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4576  putative oxidoreductase  75.8 
 
 		 291 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1976  putative oxidoreductase  73.4 
 
 		 291 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1859  putative oxidoreductase  74.82 
 
 		 297 aa  435  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0010  putative oxidoreductase  71.73 
 
 		 300 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737964  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6037  aldo/keto reductase  73.85 
 
 		 293 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5911  putative oxidoreductase  71.99 
 
 		 292 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0218  aldo/keto reductase  74.2 
 
 		 293 aa  428  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4852  putative oxidoreductase  72.44 
 
 		 294 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3775  putative oxidoreductase  72.44 
 
 		 294 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6534  putative oxidoreductase  71.63 
 
 		 315 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.35079 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2112  putative oxidoreductase  70.21 
 
 		 288 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3802  aldo/keto reductase  73.14 
 
 		 293 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1935  aldo/keto reductase  73.67 
 
 		 289 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0134693 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2685  aldo/keto reductase  70.57 
 
 		 302 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.346212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2776  putative oxidoreductase  71.89 
 
 		 292 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6338  putative oxidoreductase  72.44 
 
 		 291 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6038  putative oxidoreductase  71.13 
 
 		 291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.796364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4700  aldo/keto reductase  73.4 
 
 		 297 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0809909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3184  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  67.86 
 
 		 287 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.11057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3050  putative oxidoreductase  68.9 
 
 		 287 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378412  normal  0.0203224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2646  putative oxidoreductase  68.33 
 
 		 293 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0299  putative oxidoreductase  68.44 
 
 		 292 aa  388  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876534  normal  0.304239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5769  putative oxidoreductase  62.81 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1273  putative oxidoreductase  63.03 
 
 		 292 aa  362  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19120  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  62.63 
 
 		 310 aa  351  8e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.418593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1340  aldo/keto reductase  61.92 
 
 		 293 aa  348  7e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01373  hypothetical protein  99.42 
 
 		 173 aa  347  9e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182125  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01361  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  99.42 
 
 		 177 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185196  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1317  aldo/keto reductase  60.71 
 
 		 290 aa  347  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4436  aldo/keto reductase  58.76 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6751  aldo/keto reductase  59.26 
 
 		 275 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1135  aldo/keto reductase  56.78 
 
 		 294 aa  298  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4941  aldo/keto reductase  51.56 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5322  aldo/keto reductase  50.71 
 
 		 285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5411  aldo/keto reductase  50.71 
 
 		 285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5701  aldo/keto reductase  50.71 
 
 		 285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4872  aldo/keto reductase  47.6 
 
 		 292 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4961  aldo/keto reductase  47.6 
 
 		 292 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5463  aldo/keto reductase  47.39 
 
 		 292 aa  259  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1329  aldo/keto reductase  48.19 
 
 		 291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398839  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0425  aldo/keto reductase  47.46 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2727  aldo/keto reductase  46.02 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00257706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3447  aldo/keto reductase  46.67 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5317  aldo/keto reductase  45.07 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2291  aldo/keto reductase  45.45 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1373  aldo/keto reductase  44.37 
 
 		 284 aa  228  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2555  aldo/keto reductase  47.33 
 
 		 289 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  45.91 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  44.6 
 
 		 293 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5796  aldo/keto reductase  47.35 
 
 		 294 aa  224  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869077  normal  0.651023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0446  aldo/keto reductase  44.33 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  44.13 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0263  aldo/keto reductase  44.68 
 
 		 281 aa  222  7e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00520764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5279  putative oxidoreductase  43.77 
 
 		 302 aa  221  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2253  aldo/keto reductase  40.7 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7191  aldo/keto reductase  40.71 
 
 		 281 aa  212  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3653  aldo/keto reductase  42.35 
 
 		 290 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2833  aldo/keto reductase  40.5 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0764  aldo/keto reductase  42.11 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0414529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6541  aldo/keto reductase  42.39 
 
 		 288 aa  209  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2191  aldo/keto reductase  43.89 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0942  aldo/keto reductase  42.21 
 
 		 324 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0104  aldo/keto reductase  40.42 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3405  aldo/keto reductase  41.64 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1388  aldo/keto reductase  41.28 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1564  aldo/keto reductase  41.99 
 
 		 335 aa  204  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1685  aldo/keto reductase  40.56 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3009  aldo/keto reductase  42.76 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0466908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5154  aldo/keto reductase  41.84 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4689  aldo/keto reductase  41.84 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1525  aldo/keto reductase  39.86 
 
 		 287 aa  198  7e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.135772  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2941  aldo/keto reductase  39.64 
 
 		 284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0114  aldo/keto reductase  39.72 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0449  aldo/keto reductase  39.86 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2084  aldo/keto reductase  41.2 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5232  aldo/keto reductase  40.42 
 
 		 292 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0510  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  39.58 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.372806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3205  aldo/keto reductase  37.16 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0370321 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1321  aldo/keto reductase  39.66 
 
 		 287 aa  192  8e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4269  aldo/keto reductase  39.79 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.521186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0536  aldo/keto reductase  39.5 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3682  aldo/keto reductase  39.43 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  38.52 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5118  aldo/keto reductase  40.21 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.456075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4547  aldo/keto reductase  40.29 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.877781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0889  aldo/keto reductase  41.64 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0531022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3551  aldo/keto reductase  36.68 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5228  aldo/keto reductase  41.08 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4399  aldo/keto reductase  40.49 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278504  hitchhiker  0.00297654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  31.23 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  32.8 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>