150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1719 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01409  hypothetical protein  98.87 
 
 		 353 aa  711    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2194  putative receptor  98.02 
 
 		 353 aa  704    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000873978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2058  hypothetical protein  98.3 
 
 		 353 aa  706    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132417  hitchhiker  0.00041859 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01420  hypothetical protein  98.87 
 
 		 353 aa  711    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1539  hypothetical protein  98.3 
 
 		 353 aa  707    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1634  hypothetical protein  98.87 
 
 		 353 aa  711    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.679597  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2207  putative receptor  98.87 
 
 		 353 aa  711    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0362062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1719  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  720    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023319 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1724  hypothetical protein  98.87 
 
 		 353 aa  711    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1574  putative periplasmic protein  89.52 
 
 		 353 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000189121  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1704  hypothetical protein  89.24 
 
 		 353 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188458  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1701  hypothetical protein  89.52 
 
 		 353 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.117434  normal  0.828136 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1765  hypothetical protein  88.95 
 
 		 353 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1755  hypothetical protein  89.52 
 
 		 353 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0322938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2098  hypothetical protein  80.45 
 
 		 353 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0586  putative receptor  70.8 
 
 		 358 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3495  putative receptor  40.64 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1057  putative periplasmic protein  39.58 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00889034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1100  putative receptor  37.81 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0381  hypothetical protein  33.68 
 
 		 381 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.71003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5134  hypothetical protein  29.94 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0254476  normal  0.895353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0979  hypothetical protein  27.89 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0114  hypothetical protein  26.17 
 
 		 424 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.715385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1627  hypothetical protein  26.32 
 
 		 451 aa  85.9  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1940  hypothetical protein  25.61 
 
 		 458 aa  85.9  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1667 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  25.95 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  26.72 
 
 		 1094 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1880  hypothetical protein  27.18 
 
 		 453 aa  67  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.43 
 
 		 752 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.06 
 
 		 601 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.4 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.27 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  29.28 
 
 		 810 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7052  hypothetical protein  23.97 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0830249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.67 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  30.67 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2566  hypothetical protein  22.66 
 
 		 468 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0965859  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.97 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.65 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.86 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.53 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  23.76 
 
 		 819 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.75 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.54 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  26.01 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  26.01 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.07 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.97 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.53 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.09 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.83 
 
 		 479 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0625  hypothetical protein  31.73 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.578108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1437  hypothetical protein  25.47 
 
 		 306 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3159  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.26 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.35 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.41 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.33 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.26 
 
 		 312 aa  53.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.38 
 
 		 320 aa  53.9  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.58 
 
 		 652 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0079  hypothetical protein  24.86 
 
 		 345 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781813  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.07 
 
 		 366 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0062  hypothetical protein  24.86 
 
 		 345 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.85 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.53 
 
 		 829 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.59 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.2 
 
 		 660 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  24.56 
 
 		 479 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.28 
 
 		 974 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  23.98 
 
 		 314 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2457  cytochrome d1 heme region  24.87 
 
 		 660 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3472  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.37 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  23.02 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  24.79 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.82 
 
 		 818 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.81 
 
 		 366 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.8 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.13 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.28 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.86 
 
 		 366 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.9 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 776 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.53 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.26 
 
 		 1067 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.83 
 
 		 689 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.41 
 
 		 334 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 328 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  23.93 
 
 		 971 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.39 
 
 		 327 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.06 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26380  Twin-arginine translocation pathway signal  22.98 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.933141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.06 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.27 
 
 		 478 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581027  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2667  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.27 
 
 		 478 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896868  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2626  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.63 
 
 		 659 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.47 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.61 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>