More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1621 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01502  predicted transporter  99.77 
 
 		 427 aa  858    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2102  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  99.77 
 
 		 427 aa  858    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01513  hypothetical protein  99.77 
 
 		 427 aa  858    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0227529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2159  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  99.3 
 
 		 427 aa  853    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0943239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  100 
 
 		 455 aa  919    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2637  major facilitator superfamily MFS_1  77.85 
 
 		 473 aa  683    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1633  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  99.77 
 
 		 427 aa  858    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000157893  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1831  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  83.96 
 
 		 446 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1038  major facilitator superfamily MFS_1  79.82 
 
 		 457 aa  714    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1665  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  84.2 
 
 		 446 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0804  major facilitator superfamily MFS_1  81.65 
 
 		 457 aa  707    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319544  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1934  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  83.97 
 
 		 459 aa  762    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2115  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  99.77 
 
 		 427 aa  858    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0135318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1677  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  84.2 
 
 		 446 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.905645 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1618  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  84.2 
 
 		 446 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1268  major facilitator superfamily MFS_1  77.51 
 
 		 473 aa  701    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1609  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  84.2 
 
 		 446 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1752  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  99.53 
 
 		 427 aa  858    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000473238  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  57.55 
 
 		 467 aa  527  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  56.43 
 
 		 468 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  54.99 
 
 		 468 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3276  major facilitator superfamily MFS_1  54.89 
 
 		 460 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2130  major facilitator superfamily MFS_1  53.22 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  42.53 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  42.92 
 
 		 450 aa  371  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4465  major facilitator transporter  42.32 
 
 		 460 aa  372  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  41.74 
 
 		 464 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 		 466 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 474 aa  273  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3726  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787651  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 457 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 457 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 457 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  35.7 
 
 		 468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3115  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  34.95 
 
 		 430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1912  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 		 475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0627  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 446 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 439 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 439 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 439 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 435 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 435 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 435 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 435 aa  246  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  34.01 
 
 		 447 aa  246  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 449 aa  246  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 450 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  34.05 
 
 		 437 aa  240  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 449 aa  237  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 457 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 441 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 457 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  33.49 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  33.33 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.33 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  33.33 
 
 		 438 aa  233  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 461 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 461 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  33.49 
 
 		 438 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  34.2 
 
 		 436 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 458 aa  232  9e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  34.13 
 
 		 438 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4290  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.720009 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  34.51 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  33.33 
 
 		 438 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 447 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 442 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1594  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 442 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000379312 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  33.1 
 
 		 430 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 		 435 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.96 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  34.6 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  35 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 461 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46710  Major facilitator superfamily transporter  33.85 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  32.55 
 
 		 439 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.4 
 
 		 437 aa  226  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 436 aa  226  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 436 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 436 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>