72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1503 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1949  3-dehydroquinate dehydratase, type I  100 
 
 
252 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1503  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
252 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191866 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1909  3-dehydroquinate dehydratase  99.21 
 
 
252 aa  508  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2409  3-dehydroquinate dehydratase  98.81 
 
 
252 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.607229 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01662  3-dehydroquinate dehydratase  98.41 
 
 
252 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1774  3-dehydroquinate dehydratase  98.41 
 
 
252 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1938  3-dehydroquinate dehydratase  98.41 
 
 
252 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211983 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1896  3-dehydroquinate dehydratase  98.02 
 
 
252 aa  501  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01651  hypothetical protein  98.41 
 
 
252 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1814  3-dehydroquinate dehydratase  80.95 
 
 
252 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1985  3-dehydroquinate dehydratase  80.56 
 
 
252 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1454  3-dehydroquinate dehydratase  80.56 
 
 
252 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.287229  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1489  3-dehydroquinate dehydratase  80.56 
 
 
252 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0179338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1470  3-dehydroquinate dehydratase  80.25 
 
 
243 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21823  normal  0.0154029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1386  3-dehydroquinate dehydratase  73.41 
 
 
252 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2188  3-dehydroquinate dehydratase  52 
 
 
253 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2125  3-dehydroquinate dehydratase, type I  46.48 
 
 
270 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06550  3-dehydroquinate dehydratase, type I  44.22 
 
 
255 aa  223  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1391  3-dehydroquinate dehydratase, type I  41.92 
 
 
277 aa  188  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2355  3-dehydroquinate dehydratase, type I  38.78 
 
 
246 aa  182  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.1738899999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12510  3-dehydroquinate dehydratase, type I  38.34 
 
 
259 aa  177  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2881  3-dehydroquinate dehydratase  38.1 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2023  3-dehydroquinate dehydratase  38.65 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15040  3-dehydroquinate dehydratase, type I  38.11 
 
 
264 aa  155  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0198448  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2381  3-dehydroquinate dehydratase  39.34 
 
 
264 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3464  3-dehydroquinate dehydratase, type I  39.04 
 
 
262 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0688  3-dehydroquinate dehydratase  31.49 
 
 
225 aa  115  5e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.952141  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0845  3-dehydroquinate dehydratase  30.04 
 
 
238 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.403123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0828  3-dehydroquinate dehydratase  30.04 
 
 
238 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0481  3-dehydroquinate dehydratase  30.23 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1805  3-dehydroquinate dehydratase  30.93 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000149393  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1379  3-dehydroquinate dehydratase  29.61 
 
 
225 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0591105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0922  3-dehydroquinate dehydratase  33.18 
 
 
242 aa  102  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1999  3-dehydroquinate dehydratase  31.65 
 
 
233 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00820  3-dehydroquinate dehydratase  30.29 
 
 
268 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1160  3-dehydroquinate dehydratase  28.72 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26294  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0184  3-dehydroquinate dehydratase  34.76 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.836768  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0705  3-dehydroquinate dehydratase, type I  34.32 
 
 
218 aa  94.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.555619  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0639  3-dehydroquinate dehydratase, type I  33.18 
 
 
218 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0375735  normal  0.0370197 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1279  3-dehydroquinate dehydratase, type I  33.48 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.02452  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0220  3-dehydroquinate dehydratase, type I  34.45 
 
 
217 aa  91.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.26016  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1495  3-dehydroquinate dehydratase  30.93 
 
 
235 aa  85.9  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.065136 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0132  3-dehydroquinate dehydratase, type I  32.23 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0627989  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1815  3-dehydroquinate dehydratase  26.82 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.628603  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1460  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.25 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588162  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0540  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.06 
 
 
226 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3033  3-dehydroquinate dehydratase  31.25 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4110  3-dehydroquinate dehydratase / shikimate dehydrogenase  27.89 
 
 
613 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2806  3-dehydroquinate dehydratase  31.53 
 
 
300 aa  72  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  30.73 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0010  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.9 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.406565  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2171  3-dehydroquinate dehydratase  27.9 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.70771  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1182  3-dehydroquinate dehydratase  35.47 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2722  3-dehydroquinate dehydratase  28.23 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0551  3-dehydroquinate dehydratase  25.32 
 
 
223 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.93599 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0979  dehydroquinase class I  31.95 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0127705  normal  0.936992 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39392  predicted protein  28.8 
 
 
526 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_002936  DET0466  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.17 
 
 
222 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_409  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.17 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1839  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.11 
 
 
517 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172427  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0443  3-dehydroquinate dehydratase  28.5 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.277554  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1789  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.62 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0808  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.05 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.716383  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1652  hypothetical protein  33.64 
 
 
473 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00124545 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0600  dehydroquinase class I  32.26 
 
 
234 aa  58.5  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10544  pentafunctional AROM polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06460)  27.89 
 
 
688 aa  57.4  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.572044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2603  dehydroquinase class I  27.83 
 
 
197 aa  56.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.635582  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2038  chorismate mutase  26.05 
 
 
295 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0817  3-dehydroquinate dehydratase  26.29 
 
 
247 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1295  dehydroquinase class I  25.29 
 
 
209 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0951135  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1570  dehydroquinase class I  26.44 
 
 
209 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251567  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01990  aromatic amino acid family biosynthesis-related protein, putative  24.12 
 
 
1611 aa  46.6  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>