More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1497 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01667  predicted electron transfer flavoprotein, FAD-binding  99.36 
 
 
312 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1944  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  98.72 
 
 
312 aa  636    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.436869  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01656  hypothetical protein  99.36 
 
 
312 aa  639    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2415  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  99.04 
 
 
312 aa  637    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1497  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  100 
 
 
312 aa  643    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.186284 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1915  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  99.04 
 
 
312 aa  638    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1933  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  98.08 
 
 
312 aa  630  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0148505 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1901  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  98.4 
 
 
312 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1449  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  74.04 
 
 
311 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  0.334512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1819  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  74.36 
 
 
311 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1483  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  74.04 
 
 
311 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.327265  normal  0.060964 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1991  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  73.72 
 
 
311 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.0177014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1465  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  73.72 
 
 
311 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.486189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1396  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  67.19 
 
 
317 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0992416  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3231  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.17 
 
 
314 aa  333  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7218  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4040  electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.88 
 
 
313 aa  326  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2678  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  52.88 
 
 
313 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4605  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  48.06 
 
 
315 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1020  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  48.24 
 
 
315 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0082  putative electron transfer flavoprotein FixB  45.37 
 
 
313 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0083  putative electron transfer flavoprotein FixB  45.37 
 
 
313 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0082  putative electron transfer flavoprotein FixB  45.37 
 
 
313 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0085  putative electron transfer flavoprotein FixB  45.05 
 
 
313 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0086  putative electron transfer flavoprotein FixB  45.05 
 
 
313 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.424213 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0046  putative electron transfer flavoprotein FixB  44.27 
 
 
313 aa  277  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0044  putative electron transfer flavoprotein FixB  43.95 
 
 
313 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.676424  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00046  predicted electron transfer flavoprotein, NAD/FAD-binding domain and ETFP adenine nucleotide-binding domain-like protein  43.95 
 
 
313 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3557  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.95 
 
 
313 aa  275  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3613  putative electron transfer flavoprotein FixB  43.95 
 
 
313 aa  275  8e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00045  hypothetical protein  43.95 
 
 
313 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0046  putative electron transfer flavoprotein FixB  43.95 
 
 
313 aa  275  9e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0048  putative electron transfer flavoprotein FixB  43.95 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0312  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.05 
 
 
297 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0573  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  45.45 
 
 
312 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.18897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3929  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.83 
 
 
319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326065 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02680  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.7 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.867701 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2872  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.89 
 
 
305 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0266  hypothetical protein  32.1 
 
 
319 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1842  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.25 
 
 
296 aa  175  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08780  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.45 
 
 
295 aa  168  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.821197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2007  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.03 
 
 
298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.175857 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1823  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.8 
 
 
293 aa  165  8e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.207117  normal  0.343811 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3105  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.08 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291698 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.79 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.31 
 
 
325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.79 
 
 
325 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.14 
 
 
299 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131964  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.21 
 
 
325 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  33.21 
 
 
325 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.21 
 
 
325 aa  159  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  33.21 
 
 
325 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0755  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.46 
 
 
300 aa  158  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.714567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.21 
 
 
325 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.85 
 
 
325 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  32.85 
 
 
325 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.85 
 
 
325 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.85 
 
 
325 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.87 
 
 
325 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.87 
 
 
601 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0915  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.19 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0314059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.33 
 
 
410 aa  152  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.51 
 
 
335 aa  150  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.84 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.47 
 
 
339 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0576  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.91 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.248124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.94 
 
 
329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.19 
 
 
320 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.12 
 
 
340 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.4 
 
 
439 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.52 
 
 
442 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.09 
 
 
442 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0332  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.04 
 
 
287 aa  143  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.77 
 
 
327 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.77 
 
 
326 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2121  electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.92 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2056  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.44 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.32 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  33.89 
 
 
360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5871  protein FixB  34.78 
 
 
368 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.86 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3759  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.2 
 
 
321 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0995938  hitchhiker  0.00147037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.03 
 
 
443 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.56 
 
 
334 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.53 
 
 
368 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  31.91 
 
 
443 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  31.12 
 
 
335 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  31.12 
 
 
335 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0141  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.2 
 
 
369 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0985  electron transfer flavoprotein subunit beta  31.85 
 
 
367 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1089  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.44 
 
 
368 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419334  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.07 
 
 
329 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  28.12 
 
 
325 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.64 
 
 
399 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.21 
 
 
329 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  31.76 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480174  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5047  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.53 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4447  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.76 
 
 
369 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.21 
 
 
317 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.52 
 
 
311 aa  135  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  29.61 
 
 
441 aa  135  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>