85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1450 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1450  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499518 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1900  protein of unknown function DUF886  98.43 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.290117  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01711  hypothetical protein  98.43 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01699  hypothetical protein  98.43 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2459  hypothetical protein  98.95 
 
 		 191 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.984469  normal  0.742679 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1985  hypothetical protein  98.43 
 
 		 191 aa  393  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.280808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1824  hypothetical protein  98.43 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1890  hypothetical protein  98.43 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0233049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1962  hypothetical protein  98.95 
 
 		 191 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1702  hypothetical protein  71.89 
 
 		 185 aa  288  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2653  protein of unknown function DUF886  37.22 
 
 		 181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0159203  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2080  hypothetical protein  39.13 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1255  protein of unknown function DUF886  37.5 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2219  hypothetical protein  39.77 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2110  putative cold inducible protein Ves  39.77 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.560471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2853  hypothetical protein  36.21 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2509  hypothetical protein  39.18 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2714  hypothetical protein  40.94 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630107  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1036  hypothetical protein  36.09 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.257872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0163  protein of unknown function DUF886  35.98 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0151  hypothetical protein  32.76 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3647  hypothetical protein  34.46 
 
 		 233 aa  92.8  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1294  hypothetical protein  42.2 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.070134  normal  0.0207913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2962  hypothetical protein  31.54 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal  0.713874 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6926  protein of unknown function DUF886  37.2 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0684944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2588  hypothetical protein  32.22 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4558  protein of unknown function DUF886  36.44 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.996981  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3760  hypothetical protein  34.65 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5955  hypothetical protein  40.91 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1823  hypothetical protein  39.13 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2169  hypothetical protein  37.14 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5908  hypothetical protein  37.14 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2186  hypothetical protein  37.86 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3489  protein of unknown function DUF886  31.5 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5173  hypothetical protein  31.61 
 
 		 206 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5931  protein of unknown function DUF886  38.18 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.810198  normal  0.153687 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5479  hypothetical protein  36.94 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2208  hypothetical protein  36.67 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2085  hypothetical protein  34.67 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1811  hypothetical protein  36.04 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120207  normal  0.474402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0430  hypothetical protein  31.21 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.359855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0325  hypothetical protein  35.09 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2982  hypothetical protein  37.84 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1533  protein of unknown function DUF886  34.17 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2944  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0359  hypothetical protein  40.21 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2793  hypothetical protein  38.79 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0648  hypothetical protein  38.79 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1678  hypothetical protein  38.79 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2720  hypothetical protein  38.79 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2664  hypothetical protein  38.79 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2922  hypothetical protein  38.79 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2363  hypothetical protein  38.79 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.472112  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1431  hypothetical protein  36 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0365  hypothetical protein  35.54 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4629  hypothetical protein  36.54 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.355004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2522  hypothetical protein  39.45 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0835202  normal  0.0112976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0982  protein of unknown function DUF886  34.58 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.429638  normal  0.105211 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1101  hypothetical protein  33.6 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0858704  normal  0.979961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4156  hypothetical protein  33.64 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.737957  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5084  hypothetical protein  32.31 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5837  hypothetical protein  35.19 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67410  hypothetical protein  32.14 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1400  hypothetical protein  34.26 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2794  protein of unknown function DUF886  37.84 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2387  protein of unknown function DUF886  36.94 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5034  hypothetical protein  32 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0933  hypothetical protein  38 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0875  hypothetical protein  38 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4908  hypothetical protein  32 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1335  hypothetical protein  32.73 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3002  hypothetical protein  30.97 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.530397  normal  0.657426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2870  hypothetical protein  31.06 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.290412  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1388  hypothetical protein  29.51 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0920868  hitchhiker  0.00023617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1489  protein of unknown function DUF886  31.06 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.409079  normal  0.364485 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3016  hypothetical protein  30.3 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0248  hypothetical protein  30.54 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2887  hypothetical protein  29.55 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0164  hypothetical protein  28.48 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4074  hypothetical protein  32.43 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5071  protein of unknown function DUF886  37.04 
 
 		 181 aa  51.6  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3904  hypothetical protein  35.14 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.664963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0070  hypothetical protein  28.75 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1080  hypothetical protein  27.05 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.62386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>