28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1175 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1175  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  100 
 
 		 121 aa  246  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000177122  hitchhiker  0.000000000000201219 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1267  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  94.21 
 
 		 121 aa  234  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00142112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1435  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  93.22 
 
 		 119 aa  224  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00173864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2267  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA homolog  92.37 
 
 		 119 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565025  hitchhiker  0.0000000001404 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2799  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA homolog  91.45 
 
 		 119 aa  219  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.629369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1441  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  90.43 
 
 		 126 aa  214  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1159  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  89.57 
 
 		 123 aa  210  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.52129 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3154  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  89.19 
 
 		 124 aa  203  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000295998  hitchhiker  0.0000000000179448 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1845  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  89.19 
 
 		 124 aa  203  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000255271  hitchhiker  0.00000000107565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1764  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  84.48 
 
 		 119 aa  203  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387819  hitchhiker  0.00606421 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1260  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  88.29 
 
 		 124 aa  203  7e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000987444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0300  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  64.66 
 
 		 120 aa  159  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1523  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  90.91 
 
 		 85 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3222  endodeoxyribonuclease RUS  40.71 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.298592  hitchhiker  0.00412793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00500  endonuclease RUS  41.96 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.377255  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2281  holiday-junction resolvase  40.16 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.328249  hitchhiker  1.35608e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4449  bacteriophage V crossover junction endodeoxyribonuclease  40.98 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00181578  unclonable  0.00000000115544 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2155  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  40.98 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259574  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00505  hypothetical protein  41.44 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.320878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1609  endodeoxyribonuclease RUS  40.71 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000257059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0821  endodeoxyribonuclease RUS  39.82 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11836  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3595  endodeoxyribonuclease RusA  33.93 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0872  endodeoxyribonuclease RusA  31.82 
 
 		 150 aa  50.1  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1129  endodeoxyribonuclease RusA  32.04 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2324  endodeoxyribonuclease RusA  27.86 
 
 		 158 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4640  endodeoxyribonuclease RusA  28.97 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000402104  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A0625  Rus  48.78 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272952  decreased coverage  0.000000305727 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_3153  endodeoxyribonuclease RusA  31.52 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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