27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1153 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1153  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000165058  hitchhiker  1.09594e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1252  hypothetical protein  87.3 
 
 		 63 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00282062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2283  hypothetical protein  87.3 
 
 		 63 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000794088  decreased coverage  2.9029200000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1782  hypothetical protein  87.3 
 
 		 63 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.430243  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1746  hypothetical protein  85.71 
 
 		 63 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000344954  decreased coverage  0.0000110997 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2067  protein of unknown function DUF1482  85.71 
 
 		 63 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00317505  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2055  hypothetical protein  85.71 
 
 		 63 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0289214  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01544  predicted protein  85.71 
 
 		 63 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01536  hypothetical protein  85.71 
 
 		 63 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000987506  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1140  hypothetical protein  61.9 
 
 		 63 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.506417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1418  hypothetical protein  65.08 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2814  hypothetical protein  45.16 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00286267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2218  hypothetical protein  45.16 
 
 		 62 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00125999  hitchhiker  4.64633e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0778  hypothetical protein  44.44 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000435757  hitchhiker  0.000897507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2407  hypothetical protein  44 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2570  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.602655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01796  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2105  hypothetical protein  38.46 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0609353  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1350  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.149922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2066  hypothetical protein  38.46 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85363  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1805  protein of unknown function DUF1482  38.46 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01808  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1795  hypothetical protein  38.46 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1995  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.713597 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1928  hypothetical protein  38.46 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1823  hypothetical protein  50 
 
 		 42 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000115799  hitchhiker  0.0000000000000162357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3176  hypothetical protein  50 
 
 		 42 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187265  hitchhiker  4.99222e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>