More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1079 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1079  ISL3 family transposase  100 
 
 
327 aa  668    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.464356 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  92.35 
 
 
539 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.65 
 
 
546 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.65 
 
 
546 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6768  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.85 
 
 
501 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403374  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.03 
 
 
509 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.2 
 
 
549 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.19 
 
 
487 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.19 
 
 
487 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.19 
 
 
487 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.19 
 
 
545 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.19 
 
 
545 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.19 
 
 
545 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5033  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.53 
 
 
570 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.42 
 
 
520 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4809  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.38 
 
 
361 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3934  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  32.17 
 
 
399 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.35 
 
 
518 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.35 
 
 
518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.27 
 
 
518 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5451  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.23 
 
 
536 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.268297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6734  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.98 
 
 
344 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.07 
 
 
562 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  28.77 
 
 
476 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.905986  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.68 
 
 
511 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.63 
 
 
378 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4090  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.83 
 
 
441 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3412  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.65 
 
 
353 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.406116  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4192  IS6 family transposase  27.37 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4192  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.55 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2371  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.94 
 
 
243 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1055  transposase  31.03 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0003  transposase  31.03 
 
 
418 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0463  transposase  31.03 
 
 
418 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0505  transposase  31.03 
 
 
418 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0560  transposase  31.03 
 
 
418 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1543  transposase  31.03 
 
 
418 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1853  transposase  31.03 
 
 
418 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1940  transposase  31.03 
 
 
418 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0399155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0151  transposase  31.03 
 
 
418 aa  59.7  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0138  transposase  30.17 
 
 
418 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4212  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  39.68 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0763  hypothetical protein  31.4 
 
 
288 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.250841  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0664  ISChy4, transposase  36.46 
 
 
108 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1535  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
241 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0363  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1119  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2608  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.904926  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1958  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0133  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0470  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1016  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1230  ISBma1, transposase, interruption-N  31.52 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1512  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1863  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3181  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3241  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1123  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1213  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2072  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1956  isrso15-transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0496  transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1783  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2342  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3784  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.109765  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0767  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0991  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0846  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.392375  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2365  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3044  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3670  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0465  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1656  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0734  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0916  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2078  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.64027  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3118  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000303493  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3162  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2866  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0302  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0156  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2341  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0136009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3446  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1283  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2654  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2187  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1380  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1226  transposase,/IS1001/IS1096/IS1165  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576272  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0456  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3176  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559377  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0180  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.017513  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1101  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0150  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.116574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0351  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1019  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1099  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2011  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2619  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2818  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2902  ISBma1, transposase  31.52 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>