234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1071 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  100 
 
 		 290 aa  594  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  96.9 
 
 		 290 aa  578  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  95.86 
 
 		 290 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  95.52 
 
 		 290 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  95.52 
 
 		 290 aa  569  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  94.48 
 
 		 290 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  95.63 
 
 		 236 aa  358  7e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  59.11 
 
 		 291 aa  355  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  58.08 
 
 		 291 aa  341  7e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  49.48 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  50.17 
 
 		 288 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  49.14 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  43.64 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  42.96 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  43.77 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  37.1 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  37.1 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  36.75 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  36.75 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  28.49 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  28.72 
 
 		 635 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  29.44 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  26.79 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  33.07 
 
 		 531 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  33.07 
 
 		 531 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  26.79 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  24.86 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  25.36 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.9 
 
 		 637 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  31.61 
 
 		 650 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  32 
 
 		 629 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  25.34 
 
 		 328 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  33.05 
 
 		 529 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.09 
 
 		 512 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.93 
 
 		 513 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  27.87 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  27.95 
 
 		 614 aa  52.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  27.78 
 
 		 523 aa  52.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  30.22 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.38 
 
 		 517 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  22.94 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  27.16 
 
 		 460 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  27.37 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.92 
 
 		 472 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  24.32 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  22.94 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  25.28 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  27.05 
 
 		 451 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  24.46 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  29.71 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  26.11 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  24.16 
 
 		 306 aa  49.7  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  37.21 
 
 		 451 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0519  GTP-binding protein EngA  24.62 
 
 		 433 aa  49.7  0.00006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1260  tRNA modification GTPase TrmE  25.89 
 
 		 449 aa  49.7  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  27.95 
 
 		 458 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  22.22 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  22.22 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 458 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 458 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 458 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 458 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 458 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  27.36 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 458 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0717  tRNA modification GTPase TrmE  35.59 
 
 		 550 aa  48.9  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  25.71 
 
 		 440 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1662  GTP-binding protein Era  29 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.438796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 458 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  26.75 
 
 		 433 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.24 
 
 		 440 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  28.57 
 
 		 506 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 458 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3073  GTP-binding protein EngA  24.34 
 
 		 435 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.348074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  30.08 
 
 		 489 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3496  GTP-binding protein EngA  26.67 
 
 		 492 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  32.67 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  24.35 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  26.52 
 
 		 449 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  23.12 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  22.22 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  29.01 
 
 		 442 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 456 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  26.53 
 
 		 438 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  23.76 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2229  GTP-binding protein Era  23.24 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  23.33 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  27.31 
 
 		 465 aa  47  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  33.05 
 
 		 566 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 452 aa  46.6  0.0005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  24.73 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  26.46 
 
 		 438 aa  46.6  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  25.56 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  33.94 
 
 		 437 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  26.29 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  27.18 
 
 		 447 aa  46.2  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  23.5 
 
 		 301 aa  45.8  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  31.67 
 
 		 520 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  26.67 
 
 		 306 aa  45.8  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  25.42 
 
 		 456 aa  45.8  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>