144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0953 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  100 
 
 		 404 aa  847    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  35.73 
 
 		 412 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  36.54 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  32.91 
 
 		 414 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  32.91 
 
 		 414 aa  199  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  32.78 
 
 		 413 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  32.78 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  32.98 
 
 		 440 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  32.23 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  33.24 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  32.24 
 
 		 524 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  32.46 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  32.61 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  32.82 
 
 		 416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  34.15 
 
 		 431 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  34.43 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  31.62 
 
 		 421 aa  176  8e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  34.28 
 
 		 408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  33.79 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  30.6 
 
 		 407 aa  170  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  32.48 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  31.96 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  28.73 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  27.68 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  30.85 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  26.98 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  31.36 
 
 		 397 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  30.71 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  28.9 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  28.57 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  29.44 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  29.59 
 
 		 392 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  28.16 
 
 		 390 aa  149  7e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  30.58 
 
 		 408 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  28.28 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  31.49 
 
 		 407 aa  147  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  29.82 
 
 		 473 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  28.75 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  27.62 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  28.11 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  28.82 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  28.11 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  28.11 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  28.33 
 
 		 544 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  29.05 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  28.68 
 
 		 395 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  26.29 
 
 		 445 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  27.27 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  24.55 
 
 		 409 aa  133  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  28.37 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  27.01 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  30.83 
 
 		 428 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  27.22 
 
 		 411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  29.5 
 
 		 411 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  25.82 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  30.1 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  28.73 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  28.1 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  28.41 
 
 		 408 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  26.27 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  28.26 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  28.26 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  27.44 
 
 		 398 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  30.28 
 
 		 391 aa  122  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  29.03 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  29.33 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  28.08 
 
 		 404 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  23.43 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  28.73 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  23.43 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  28.12 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  25.63 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  24.62 
 
 		 436 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  24.69 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  29.54 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  26.37 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  27.09 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  27.73 
 
 		 391 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  26.04 
 
 		 393 aa  106  6e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  30.11 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  28.27 
 
 		 420 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  28.97 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  32.98 
 
 		 225 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  25.31 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  24.86 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  26.85 
 
 		 396 aa  99.8  8e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  24.75 
 
 		 413 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  27.73 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  23.03 
 
 		 412 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  23.03 
 
 		 412 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  21.46 
 
 		 407 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  22.17 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  26.02 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  27.25 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  24.68 
 
 		 464 aa  94  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  23.06 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  25.91 
 
 		 447 aa  93.6  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  26.82 
 
 		 391 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  23.78 
 
 		 542 aa  92.8  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  26.88 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>