67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0952 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 
186 aa  387  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  41.9 
 
 
196 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  41.9 
 
 
196 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  44.91 
 
 
194 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  44.87 
 
 
198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  42.37 
 
 
194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  41.81 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  41.81 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  41.81 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  46.43 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  45 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  39.53 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  39.53 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  39.29 
 
 
201 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  37.06 
 
 
190 aa  104  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1679  phage prohead protease, HK97 family  38.85 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000321389  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1683  phage phi-105 ORF26-like protein  40.85 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2599  HK97 family phage prohead protease  38.56 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00442603 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2474  phage prohead protease, HK97 family  42.98 
 
 
172 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2958  phage prohead protease, HK97 family  34.97 
 
 
203 aa  91.7  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  35.97 
 
 
514 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4383  prohead protease  30.69 
 
 
239 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  31.88 
 
 
562 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5359  prophage LambdaBa03, prohead protease  38.46 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4980  prophage LambdaBa03, prohead protease  38.46 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1458  phage prohead protease, HK97 family  30.06 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2150  peptidase U35, phage prohead HK97  30.99 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0209  prophage Lp3 protein 18  32.79 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2636  HK97 family phage prohead protease  35.65 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00090927  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  30.26 
 
 
186 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  31.97 
 
 
506 aa  62.4  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  28.68 
 
 
177 aa  57.8  0.00000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5507  peptidase U35 phage prohead HK97  31.25 
 
 
196 aa  55.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  27.21 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  29.56 
 
 
240 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08240  phage prohead protease, HK97 family  33.96 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00758613  hitchhiker  0.00429473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  32.17 
 
 
240 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  31.3 
 
 
220 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  27.52 
 
 
174 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  29.01 
 
 
236 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  31.58 
 
 
189 aa  51.6  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  33.04 
 
 
144 aa  51.2  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  33.05 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  28.08 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  30.71 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  32.61 
 
 
215 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  31.62 
 
 
235 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  30.28 
 
 
159 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  32 
 
 
184 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  29.92 
 
 
177 aa  48.5  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  30.77 
 
 
190 aa  48.5  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  29.73 
 
 
248 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  33.54 
 
 
177 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  30.71 
 
 
248 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  29.92 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  29.92 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  38.96 
 
 
233 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  30.15 
 
 
149 aa  46.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  29.92 
 
 
157 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  29.27 
 
 
228 aa  45.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  31.5 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  29.57 
 
 
222 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  32.38 
 
 
139 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  29.57 
 
 
222 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3715  HK97 family phage prohead protease  29.6 
 
 
221 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3766  HK97 family phage prohead protease  29.6 
 
 
221 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  29.92 
 
 
233 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>