125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0625 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  100 
 
 
268 aa  550  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3020  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  99.6 
 
 
248 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0656  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  99.6 
 
 
248 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3039  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  99.6 
 
 
248 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0690  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  100 
 
 
248 aa  510  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678233  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00573  periplasmic disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  99.59 
 
 
253 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.023443  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  99.19 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00562  hypothetical protein  99.59 
 
 
247 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0306036  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0765  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  80.16 
 
 
248 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0660  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  77.53 
 
 
268 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0719  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  77.15 
 
 
268 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0646  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  80.16 
 
 
248 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0704  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  79.35 
 
 
248 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  0.0618042 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4182  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  64.63 
 
 
251 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0518  thiol:disulfide interchange protein DsbG  100 
 
 
141 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2031  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  53.88 
 
 
253 aa  271  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  47.84 
 
 
256 aa  258  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  47.84 
 
 
256 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  47.84 
 
 
257 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000139676  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  44.83 
 
 
252 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  45.45 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3938  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  47.06 
 
 
249 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450979  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  44.16 
 
 
252 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0514  thiol:disulfide interchange protein DsbG  98.23 
 
 
122 aa  225  7e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  42.24 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2594  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.4 
 
 
255 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67724  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  37.94 
 
 
276 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  37.94 
 
 
286 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2396  thiol:disulfide interchange protein  40.77 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.903284  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2396  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  36.58 
 
 
257 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000025188  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  34.48 
 
 
268 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1355  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  37.07 
 
 
257 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617458  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5854  protein-disulfide isomerase-like protein  32.54 
 
 
333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1397  Fis family transcriptional regulator  31.23 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1085  thiol:disulfide interchange domain protein  28.57 
 
 
274 aa  86.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00153173  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1547  hypothetical protein  25.71 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1872  thiol:disulfide interchange protein, putative  25.71 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2246  dsbG domain protein  30.28 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1896  hypothetical protein  30.28 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.649573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1018  thiol:disulfide interchange domain protein  33.33 
 
 
182 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.977804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  28.82 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3811  hypothetical protein  33.01 
 
 
193 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0275  thiol:disulfide interchange domain protein  34.12 
 
 
203 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0452  hypothetical protein  34.12 
 
 
203 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.912774  hitchhiker  0.000257257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  27.66 
 
 
248 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2228  hypothetical protein  36.25 
 
 
208 aa  58.9  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1615  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  26.71 
 
 
178 aa  58.9  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1943  dsbG domain protein  26.71 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209968  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  26.63 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1853  Fis family transcriptional regulator  27.56 
 
 
201 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.57 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2299  hypothetical protein  25.19 
 
 
399 aa  53.5  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.441757  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  25.73 
 
 
254 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  32.69 
 
 
242 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2947  thiol:disulfide interchange protein DsbG, putative  29.89 
 
 
302 aa  52.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  32.69 
 
 
242 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  32.69 
 
 
242 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.73 
 
 
242 aa  52  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  32.69 
 
 
242 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2560  hypothetical protein  29.89 
 
 
302 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.883741 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  28.7 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1057  hypothetical protein  31.91 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000413495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.7 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  32.69 
 
 
242 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.7 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.7 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.7 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  28.7 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2559  hypothetical protein  30.48 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.948214  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  28.7 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4214  hypothetical protein  25.52 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000071573  normal  0.744992 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.27 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.7 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  26.6 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  26.6 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.72 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  24.03 
 
 
237 aa  49.7  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  26.79 
 
 
238 aa  48.9  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.72 
 
 
237 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.72 
 
 
237 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.72 
 
 
237 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.72 
 
 
237 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  24.2 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  30.77 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3850  hypothetical protein  23.53 
 
 
354 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.75 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  30.77 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  29.94 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.75 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.61 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.75 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  38.71 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1066  thiol:disulfide interchange protein  20.12 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006488  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.37 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.87 
 
 
241 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.87 
 
 
241 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.86 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.85 
 
 
238 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.88 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.88 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>