16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0260 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0260  lateral flagellar chaperone protein LfgN  100 
 
 		 142 aa  290  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3374  hypothetical protein  94.37 
 
 		 142 aa  274  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0229  hypothetical protein  35.56 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0716  hypothetical protein  35.56 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0636  putative flagellar protein FlgN  34.81 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0072  hypothetical protein  32.58 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3654  hypothetical protein  28.57 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4411  hypothetical protein  26.45 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0602809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0078  hypothetical protein  30.53 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3471  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.370785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3974  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0235  hypothetical protein  27.34 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4256  FlgN  31.43 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04906  hypothetical protein  25.22 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3737  FlgN family protein  31.16 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1951  FlgN  25.47 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>