120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0252 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  100 
 
 
236 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  98.73 
 
 
236 aa  473  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  46.52 
 
 
238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  46.52 
 
 
238 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  46.09 
 
 
238 aa  217  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  46.78 
 
 
230 aa  204  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  37.99 
 
 
251 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  38.31 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  36.28 
 
 
252 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  36.04 
 
 
235 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  34.19 
 
 
235 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  33.62 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  35.91 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  31.7 
 
 
251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  35 
 
 
241 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  33.53 
 
 
225 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  28.99 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  28.63 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  27.62 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3563  flagellar assembly protein FliH  22.54 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  34.78 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  30.67 
 
 
267 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  30.72 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  25.41 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  27.69 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  29.12 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  26.11 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  28.48 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  24.6 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  28.8 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  28.83 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  29.59 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  28.99 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  26.38 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  23.08 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  25.34 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  27.27 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  25.39 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  25 
 
 
403 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  26.06 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  23.2 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  28.4 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  25.95 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  27.08 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  26.56 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  24.06 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  25.54 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  28.99 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  25.54 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  26.06 
 
 
255 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  26.47 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  27.38 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  23.63 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  23.83 
 
 
316 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  27.17 
 
 
248 aa  62  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  23.68 
 
 
375 aa  61.6  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  24.73 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  25.27 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  24.46 
 
 
320 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  24.73 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  24.73 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  24.73 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  24.73 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  24.6 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  26.06 
 
 
251 aa  58.9  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  26.38 
 
 
245 aa  58.5  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  23.89 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  27.38 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  25 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  23.89 
 
 
338 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  23.89 
 
 
338 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  23.89 
 
 
338 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  26.4 
 
 
303 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  26.06 
 
 
227 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  25.45 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  24.71 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  24.71 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.57 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  25.13 
 
 
227 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  26.04 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  25.15 
 
 
227 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  27.98 
 
 
227 aa  52  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.3 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  25.15 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  27.17 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  24 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  21.5 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  28.99 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  26.51 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  25.56 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  25.56 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  26.58 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  25.3 
 
 
227 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  23.98 
 
 
227 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  45.9 
 
 
315 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  23.03 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  35.14 
 
 
325 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  35.14 
 
 
331 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  27.17 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  22.34 
 
 
249 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>