227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0244 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0244  lateral flagellar export/assembly protein LfiQ  100 
 
 		 90 aa  169  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3388  export protein FliQ  98.89 
 
 		 90 aa  168  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0705  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.55 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00473714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0240  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.55 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331629  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  58.43 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0215  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4423  export protein FliQ  58.43 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.844817 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0166  flagellar biosynthetic protein FliQ, putative  55.06 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  50 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.59 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0090  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.09 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4647  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.31 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189721  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  51.22 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3036  flagellar biosynthetic protein FliQ  54.55 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  50.6 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.4 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  51.22 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  51.14 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02876  flagellar biosynthesis  50 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3482  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.75 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.73 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.86 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.86 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3985  export protein FliQ  50.62 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.19 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.19 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.19 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2171  flagellar hook-associated protein  48.75 
 
 		 89 aa  80.1  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.99 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  50 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.25 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  50 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.45 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.75 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3665  export protein FliQ  50.68 
 
 		 89 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3880  flagellar biosynthesis protein FliQ  51.14 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.95 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.95 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3594  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.38 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1448  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.68 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2565  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.78 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3057  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.37 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.554664  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.37 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2915  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.37 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.114624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.28 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.37 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.28 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0084  export protein FliQ  51.85 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3055  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.58 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341394  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1629  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.84 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.74 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.67 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  44 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.66 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.8 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.35 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.57 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.79 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.37 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.57 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.02 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.77 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.77 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.15 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  58.7 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.74 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  58.7 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.67 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.71 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.35 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.15 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.29 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.15 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.73 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.73 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3907  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.83 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3823  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.83 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.84 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.58 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  50 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.24 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.14 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  50 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.93 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  38.03 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0041  export protein FliQ  46.55 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.1 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.26 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.81 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0067  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.83 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.07 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0928  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.78 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0883861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.53 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  54.17 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.27 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.77 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.45 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.16 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>