More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0069 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  99.61 
 
 
254 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  99.61 
 
 
254 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  99.61 
 
 
254 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  99.21 
 
 
254 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
254 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  2.81733e-07 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  99.61 
 
 
254 aa  497  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  89.37 
 
 
255 aa  438  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  88.58 
 
 
255 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  88.98 
 
 
255 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  88.58 
 
 
255 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  88.58 
 
 
255 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  83.07 
 
 
255 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  65.88 
 
 
256 aa  326  2e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  66.02 
 
 
256 aa  325  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  66.67 
 
 
256 aa  314  9e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  62.99 
 
 
255 aa  312  3e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  58.66 
 
 
255 aa  293  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  58.66 
 
 
255 aa  293  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  58.66 
 
 
255 aa  293  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  58.27 
 
 
255 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  40.13 
 
 
437 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.8 
 
 
671 aa  117  2e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  40.13 
 
 
437 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  37.13 
 
 
641 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.47 
 
 
438 aa  115  9e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.51 
 
 
438 aa  114  1e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.16 
 
 
668 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.23092e-07  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  39.13 
 
 
438 aa  112  4e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  38.78 
 
 
176 aa  110  2e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  36.81 
 
 
681 aa  109  4e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.48877e-11  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  33.33 
 
 
220 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.03 
 
 
664 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.46 
 
 
664 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  35.22 
 
 
176 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  32.77 
 
 
220 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  35.37 
 
 
176 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  34.69 
 
 
176 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  32.7 
 
 
232 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  32.86 
 
 
678 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.71 
 
 
676 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  34.01 
 
 
176 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  32.38 
 
 
678 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  38.82 
 
 
438 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  34.18 
 
 
682 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  32.84 
 
 
218 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  34.18 
 
 
682 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  40.79 
 
 
439 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  32.5 
 
 
239 aa  99.4  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  41.26 
 
 
438 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.47 
 
 
438 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  35.58 
 
 
176 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  33.9 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.47 
 
 
438 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.16 
 
 
438 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  30.11 
 
 
695 aa  96.3  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1821  uncharacterized membrane-associated protein  30.52 
 
 
179 aa  95.9  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.274709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.63 
 
 
469 aa  95.5  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0188  hypothetical protein  30.52 
 
 
179 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0587064  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  34.48 
 
 
677 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.48 
 
 
662 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1457  hypothetical protein  32.47 
 
 
179 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  30.62 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  34.87 
 
 
176 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  28.57 
 
 
211 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  36.55 
 
 
176 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.87 
 
 
684 aa  86.7  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.76 
 
 
483 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  29.05 
 
 
241 aa  85.9  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  31.87 
 
 
684 aa  85.5  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  34.21 
 
 
173 aa  84.7  1e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  32.16 
 
 
686 aa  84  2e-15  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  29.61 
 
 
173 aa  83.2  4e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  34.21 
 
 
173 aa  82.4  6e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  34.21 
 
 
173 aa  82.4  6e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3203  SNARE associated Golgi protein  35.48 
 
 
174 aa  81.3  2e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.473398  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  27.74 
 
 
220 aa  80.9  2e-14  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.89 
 
 
664 aa  79.7  4e-14  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3643  hypothetical protein  36.6 
 
 
176 aa  79  7e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0269  DedA family protein  36.6 
 
 
176 aa  79  7e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.867407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3947  hypothetical protein  36.6 
 
 
176 aa  79  7e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
173 aa  77  2e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  27.22 
 
 
173 aa  76.6  4e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  30.59 
 
 
208 aa  75.5  8e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  32.05 
 
 
672 aa  73.2  4e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  36.91 
 
 
672 aa  72.4  6e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1058  hypothetical protein  31.37 
 
 
173 aa  70.9  2e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 
222 aa  70.1  3e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1430  hypothetical protein  31.37 
 
 
173 aa  69.3  5e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
217 aa  69.3  6e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  27.66 
 
 
203 aa  68.9  6e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  31.29 
 
 
200 aa  68.6  9e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  31.28 
 
 
502 aa  68.2  1e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  27.88 
 
 
199 aa  68.2  1e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  26.97 
 
 
201 aa  67.8  2e-10  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  30.56 
 
 
209 aa  67.8  2e-10  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  29.03 
 
 
198 aa  66.6  4e-10  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  28.95 
 
 
213 aa  64.7  1e-09  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>