More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0057 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  100 
 
 
428 aa  877  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0047  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  99.53 
 
 
428 aa  872  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.3551e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  100 
 
 
428 aa  877  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202628  hitchhiker  0.000135274 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3571  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  75.35 
 
 
434 aa  664  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0770  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  75.35 
 
 
434 aa  663  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524485  normal  0.0902851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  73.47 
 
 
432 aa  671  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00056  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  877  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0286102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3830  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  72.6 
 
 
431 aa  651  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0604  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  71.6 
 
 
433 aa  650  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  100 
 
 
428 aa  877  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.04292e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3633  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  72.37 
 
 
431 aa  649  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  70.26 
 
 
430 aa  642  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  99.77 
 
 
428 aa  877  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.68252e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0097  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  91.36 
 
 
428 aa  794  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0531154  normal  0.145307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  100 
 
 
428 aa  877  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283729  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0096  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  91.36 
 
 
428 aa  794  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.632638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0098  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  91.36 
 
 
428 aa  794  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3442  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  75.35 
 
 
434 aa  664  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.1378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0103  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  91.36 
 
 
428 aa  794  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.308469  normal  0.913442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0101  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  91.36 
 
 
428 aa  794  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.002065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  89.25 
 
 
428 aa  783  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00440274  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  100 
 
 
428 aa  877  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0538241  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3546  SurA domain protein  100 
 
 
428 aa  877  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00416172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0370  chaperone SurA precursor  47.67 
 
 
436 aa  411  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2863  survival protein SurA  46.05 
 
 
431 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00164728  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00810  hypothetical protein  45.33 
 
 
427 aa  407  1e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3419  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.67 
 
 
431 aa  400  1e-110  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0567862  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001663  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  44.63 
 
 
427 aa  401  1e-110  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03412  survival protein surA  46.7 
 
 
427 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3113  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.66 
 
 
434 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.980889  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3207  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.66 
 
 
434 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00341514  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0991  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.89 
 
 
434 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.34867e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3637  survival protein surA  42.66 
 
 
434 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0966  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.82 
 
 
434 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  1.38448e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0907  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.66 
 
 
434 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00235031  normal  0.382454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0979  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.19 
 
 
434 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.66613e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3311  SurA domain protein  42.42 
 
 
434 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000542375  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1081  SurA domain-containing protein  42.42 
 
 
434 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00545123  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1048  SurA domain-containing protein  42.42 
 
 
434 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000188646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1016  SurA domain-containing protein  41.49 
 
 
434 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.39949e-06  hitchhiker  0.00270369 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2817  survival protein surA  43.09 
 
 
434 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.705055  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3077  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.19 
 
 
434 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4524  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  43.76 
 
 
433 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0881  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.96 
 
 
434 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  3.01767e-07  normal  0.688163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2886  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.86 
 
 
434 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  3.30996e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0864  SurA domain-containing protein  41.77 
 
 
434 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.62907e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  41.47 
 
 
441 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  41.71 
 
 
439 aa  339  6e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  41.71 
 
 
439 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  41.09 
 
 
441 aa  338  1e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0565  peptidylprolyl cis-trans isomerase SurA  43.86 
 
 
433 aa  337  2e-91  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.306851  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.05 
 
 
442 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  39.86 
 
 
428 aa  327  2e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5133  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.81 
 
 
426 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  40.19 
 
 
430 aa  321  2e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  39.72 
 
 
430 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.4 
 
 
430 aa  314  2e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.52 
 
 
435 aa  313  4e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00205446  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1049  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37 
 
 
439 aa  312  9e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352808  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46810  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  41.9 
 
 
432 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0780873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  37.86 
 
 
430 aa  302  6e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.1 
 
 
426 aa  301  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  37.91 
 
 
454 aa  300  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  35.85 
 
 
429 aa  296  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  35.61 
 
 
429 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  37.31 
 
 
475 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2715  SurA domain protein  34.88 
 
 
443 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109912  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04643  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.83 
 
 
463 aa  265  8e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0287725  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0670  SurA domain  34.23 
 
 
447 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.7 
 
 
471 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3469  SurA domain protein  35.7 
 
 
471 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.955997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4862  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.66 
 
 
473 aa  264  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042366 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.65 
 
 
437 aa  263  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0200  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.21 
 
 
433 aa  259  5e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3509  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.96 
 
 
447 aa  256  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2338  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.16 
 
 
436 aa  254  1e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4811  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.89 
 
 
482 aa  252  8e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4075  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.83 
 
 
469 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  33.73 
 
 
438 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6034  SurA domain-containing protein  35.91 
 
 
475 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3658  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.34 
 
 
438 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486041  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2011  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.18 
 
 
468 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1935  SurA domain-containing protein  32.25 
 
 
463 aa  246  7e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.41 
 
 
493 aa  242  8e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  33.74 
 
 
465 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3912  SurA domain-containing protein  35.07 
 
 
464 aa  240  3e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0097  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.52 
 
 
459 aa  241  3e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1021  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.7 
 
 
427 aa  239  6e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4023  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.12 
 
 
453 aa  239  6e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285362  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0203  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.16 
 
 
437 aa  239  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.701939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.57 
 
 
498 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644007  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0676  SurA domain  34.63 
 
 
453 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0498  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.57 
 
 
499 aa  236  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.307717  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5274  SurA domain protein  33.41 
 
 
469 aa  236  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4763  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.08 
 
 
476 aa  235  1e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0397  SurA domain-containing protein  33.98 
 
 
463 aa  234  2e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.19 
 
 
440 aa  234  2e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0407  SurA domain protein  33.41 
 
 
500 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0392  SurA domain  33.17 
 
 
500 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2628  SurA domain-containing protein  34.62 
 
 
452 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222069  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>