More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0055 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
273 aa  564  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  564  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
273 aa  564  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
273 aa  564  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
273 aa  564  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
273 aa  564  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  99.63 
 
 
273 aa  563  1e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  99.63 
 
 
273 aa  563  1e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  99.63 
 
 
273 aa  563  1e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  94.87 
 
 
273 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  94.87 
 
 
273 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  94.87 
 
 
273 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  94.87 
 
 
273 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  94.51 
 
 
273 aa  538  1e-152  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  89.01 
 
 
273 aa  516  1e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  80.15 
 
 
272 aa  460  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  80.15 
 
 
272 aa  460  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  79.78 
 
 
272 aa  459  1e-128  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  80.51 
 
 
272 aa  454  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  79.78 
 
 
272 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  80.15 
 
 
272 aa  452  1e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  77.94 
 
 
272 aa  450  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  76.84 
 
 
272 aa  441  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  67.42 
 
 
269 aa  380  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  67.42 
 
 
269 aa  381  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  65.47 
 
 
281 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  66.04 
 
 
277 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  67.05 
 
 
270 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  66.29 
 
 
271 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  63.3 
 
 
269 aa  355  3e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  64.62 
 
 
268 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  62.78 
 
 
267 aa  348  7e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  62.92 
 
 
268 aa  345  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  63.67 
 
 
267 aa  345  6e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  62.55 
 
 
268 aa  342  3e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  62.55 
 
 
268 aa  342  3e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  62.55 
 
 
268 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  62.55 
 
 
268 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  58.36 
 
 
301 aa  341  6e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  62.78 
 
 
268 aa  341  7e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  62.78 
 
 
268 aa  341  8e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  62.5 
 
 
267 aa  339  3e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  62.41 
 
 
268 aa  339  3e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  62.41 
 
 
268 aa  339  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  61.42 
 
 
267 aa  338  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  61.05 
 
 
267 aa  337  1e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  62.03 
 
 
268 aa  334  7e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  59.85 
 
 
271 aa  326  3e-88  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03414  dimethyladenosine transferase  62.95 
 
 
252 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  56.03 
 
 
255 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  52.4 
 
 
276 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  54.58 
 
 
274 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  54.68 
 
 
281 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2626  dimethyladenosine transferase  54.24 
 
 
273 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0696362  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2760  dimethyladenosine transferase  54.24 
 
 
276 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  54.24 
 
 
275 aa  278  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  52.79 
 
 
275 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  52.79 
 
 
275 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  53.93 
 
 
281 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  52.94 
 
 
282 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2424  dimethyladenosine transferase  52.42 
 
 
275 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  52.42 
 
 
275 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  52.42 
 
 
275 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  52.42 
 
 
275 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  51.27 
 
 
278 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0874  dimethyladenosine transferase  52.42 
 
 
275 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2735  dimethyladenosine transferase  53.87 
 
 
275 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486994  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2708  dimethyladenosine transferase  53.87 
 
 
275 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2096  dimethyladenosine transferase  53.87 
 
 
275 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  53.64 
 
 
268 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  52.11 
 
 
266 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  55.3 
 
 
281 aa  275  9e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0591  dimethyladenosine transferase  53.51 
 
 
275 aa  274  1e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  53.64 
 
 
268 aa  273  1e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  50.97 
 
 
255 aa  273  2e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  51.34 
 
 
266 aa  273  2e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  51.09 
 
 
278 aa  271  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  52.71 
 
 
272 aa  271  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  52.92 
 
 
269 aa  271  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  52.33 
 
 
268 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  51.91 
 
 
267 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  52.12 
 
 
268 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  51.53 
 
 
266 aa  270  3e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0578  dimethyladenosine transferase  52.87 
 
 
275 aa  268  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  52.83 
 
 
277 aa  268  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  52.49 
 
 
272 aa  266  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0096  dimethyladenosine transferase  53.64 
 
 
261 aa  266  3e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  51.15 
 
 
267 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0399  dimethyladenosine transferase  52.11 
 
 
276 aa  265  9e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  52.22 
 
 
276 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  49.43 
 
 
269 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  50.76 
 
 
267 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  53.33 
 
 
255 aa  262  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  53.05 
 
 
268 aa  261  7e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  49.44 
 
 
272 aa  259  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  51.97 
 
 
268 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3468  dimethyladenosine transferase  51.15 
 
 
253 aa  258  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4110  dimethyladenosine transferase  51.15 
 
 
253 aa  258  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  52.92 
 
 
255 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  50.19 
 
 
256 aa  256  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>