13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0052 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0052  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.79454  normal  0.653619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6367  hypothetical protein  53.68 
 
 		 199 aa  211  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2753  hypothetical protein  44.74 
 
 		 196 aa  181  9.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2283  hypothetical protein  45.7 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6159  hypothetical protein  47.49 
 
 		 204 aa  174  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2112  hypothetical protein  45.05 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.870812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2007  hypothetical protein  44.75 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000443112 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3137  hypothetical protein  44.63 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2983  hypothetical protein  43.65 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.206465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2298  hypothetical protein  42.08 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0662  hypothetical protein  37.57 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6206  hypothetical protein  43.09 
 
 		 200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0219288  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1570  hypothetical protein  37.08 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>