267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0050 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  100 
 
 
196 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  100 
 
 
196 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  99.49 
 
 
196 aa  404  1e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  100 
 
 
159 aa  333  7e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  333  7e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  100 
 
 
159 aa  333  7e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  100 
 
 
159 aa  333  7e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  100 
 
 
159 aa  333  7e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  99.37 
 
 
159 aa  332  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  96.86 
 
 
159 aa  328  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  96.86 
 
 
159 aa  328  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  96.86 
 
 
159 aa  328  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  96.86 
 
 
159 aa  328  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  96.86 
 
 
159 aa  328  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  91.82 
 
 
159 aa  312  2e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  80.5 
 
 
160 aa  279  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  80.5 
 
 
160 aa  279  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  80.5 
 
 
160 aa  279  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  80.5 
 
 
165 aa  278  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  79.25 
 
 
160 aa  272  2e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  79.25 
 
 
160 aa  268  3e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  78.62 
 
 
160 aa  268  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0559  dihydrofolate reductase  79.25 
 
 
160 aa  263  8e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  56.6 
 
 
163 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  52.2 
 
 
159 aa  180  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  52.2 
 
 
159 aa  177  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0561  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 
165 aa  175  4e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 
170 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  51.25 
 
 
165 aa  165  3e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  48.26 
 
 
173 aa  163  1e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 
161 aa  162  4e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  51.57 
 
 
177 aa  161  5e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  54.17 
 
 
160 aa  161  5e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  48.54 
 
 
171 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  55.8 
 
 
160 aa  158  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  49.38 
 
 
162 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  55.8 
 
 
160 aa  157  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  50.94 
 
 
160 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
175 aa  156  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  55.07 
 
 
160 aa  154  5e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  50.31 
 
 
167 aa  154  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  55.64 
 
 
160 aa  153  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  2.43395e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  50.99 
 
 
160 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  52.52 
 
 
160 aa  152  3e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  52.08 
 
 
160 aa  152  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  52.9 
 
 
160 aa  150  9e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 
166 aa  149  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  55.71 
 
 
160 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  55.71 
 
 
160 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 
165 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  50 
 
 
172 aa  148  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  55 
 
 
160 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  55 
 
 
160 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
171 aa  147  1e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  49.67 
 
 
160 aa  147  1e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 
169 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  44.24 
 
 
167 aa  144  7e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 
160 aa  144  8e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.8363e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 
176 aa  144  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
162 aa  143  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  40 
 
 
162 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  1.00648e-11 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 
171 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 
166 aa  141  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  39.38 
 
 
162 aa  141  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
167 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  43.98 
 
 
166 aa  141  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  47.2 
 
 
163 aa  140  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  45.06 
 
 
167 aa  140  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  43.12 
 
 
161 aa  140  9e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  46.54 
 
 
161 aa  140  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  43.12 
 
 
161 aa  140  9e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  39.38 
 
 
162 aa  140  1e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  41.77 
 
 
161 aa  140  1e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.86123e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
167 aa  140  1e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  43.03 
 
 
167 aa  140  1e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  39.38 
 
 
162 aa  140  1e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.30652e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  43.03 
 
 
167 aa  140  1e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
167 aa  140  1e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
167 aa  140  1e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  39.38 
 
 
162 aa  140  1e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 
172 aa  140  1e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
167 aa  140  1e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  39.38 
 
 
162 aa  140  1e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  39.38 
 
 
162 aa  140  1e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  39.38 
 
 
162 aa  140  1e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  39.38 
 
 
162 aa  140  1e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
167 aa  140  1e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 
172 aa  139  2e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 
174 aa  139  4e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 
167 aa  139  4e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 
170 aa  139  4e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  38.75 
 
 
162 aa  139  4e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 
170 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 
161 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
163 aa  136  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 
167 aa  135  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 
166 aa  134  6e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  43.48 
 
 
162 aa  134  7e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.74022e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 
166 aa  134  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  43.67 
 
 
166 aa  134  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>