More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0045 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  100 
 
 
428 aa  871  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  99.53 
 
 
428 aa  867  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  99.07 
 
 
428 aa  863  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  99.53 
 
 
428 aa  867  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  88.79 
 
 
428 aa  785  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  89.02 
 
 
428 aa  787  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  88.79 
 
 
428 aa  785  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  88.55 
 
 
428 aa  783  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  88.79 
 
 
428 aa  785  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  99.3 
 
 
428 aa  864  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  99.53 
 
 
428 aa  867  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  99.53 
 
 
428 aa  867  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  99.53 
 
 
428 aa  867  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  62.56 
 
 
430 aa  565  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  63.32 
 
 
430 aa  551  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  61.36 
 
 
429 aa  547  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  61.07 
 
 
429 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  61.07 
 
 
429 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  60.84 
 
 
429 aa  528  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  60.37 
 
 
429 aa  527  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.84 
 
 
429 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  61.77 
 
 
429 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  60.61 
 
 
429 aa  525  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  60.37 
 
 
429 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  59.91 
 
 
429 aa  523  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  59.67 
 
 
428 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  59.67 
 
 
428 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  59.67 
 
 
428 aa  508  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  59.67 
 
 
428 aa  507  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  59.67 
 
 
428 aa  507  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  56.57 
 
 
429 aa  494  1e-138  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  54.88 
 
 
430 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.86 
 
 
430 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  49.65 
 
 
431 aa  417  1e-115  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  49.88 
 
 
431 aa  402  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  49.41 
 
 
442 aa  389  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  46.73 
 
 
431 aa  383  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  45.96 
 
 
472 aa  381  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  7.90545e-05 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2124  hypothetical protein  49.11 
 
 
428 aa  357  3e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27800  flavin-dependent dehydrogenase  44.76 
 
 
439 aa  352  9e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.44 
 
 
432 aa  345  8e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08770  flavin-dependent dehydrogenase  44.16 
 
 
437 aa  340  2e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2906  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.12 
 
 
423 aa  322  6e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4021  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40.89 
 
 
423 aa  321  2e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3068  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40.65 
 
 
423 aa  320  4e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  41.4 
 
 
442 aa  319  6e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02611  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  40.19 
 
 
423 aa  315  9e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0922  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.19 
 
 
423 aa  315  9e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.713397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02574  hypothetical protein  40.19 
 
 
423 aa  315  9e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0946  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.19 
 
 
423 aa  315  1e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2895  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40.19 
 
 
423 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3107  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40.19 
 
 
422 aa  309  7e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  43.85 
 
 
434 aa  308  2e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.19 
 
 
425 aa  307  3e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  41.26 
 
 
432 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.21 
 
 
434 aa  296  6e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  39.72 
 
 
433 aa  296  7e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.64 
 
 
436 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  42.16 
 
 
432 aa  287  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.98 
 
 
433 aa  284  2e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10540  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, FixC  42.28 
 
 
432 aa  284  2e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106956  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.65 
 
 
436 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  9.88984e-05  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5870  FixC protein  39.04 
 
 
435 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100427  normal  0.798669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.9 
 
 
430 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1194  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.89 
 
 
432 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0537689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1478  fixC protein  40.89 
 
 
432 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.37 
 
 
435 aa  276  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.96 
 
 
436 aa  272  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0140  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.92 
 
 
435 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.942085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5084  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.71 
 
 
435 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.65 
 
 
436 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4013  FAD dependent oxidoreductase  36.87 
 
 
435 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0986  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.89 
 
 
435 aa  262  7e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.105953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3614  FAD dependent oxidoreductase  36.11 
 
 
435 aa  259  5e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119671 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2135  FAD dependent oxidoreductase  39 
 
 
424 aa  258  1e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  38.97 
 
 
431 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0648  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 
424 aa  255  9e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.567553  hitchhiker  0.0038978 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1090  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.68 
 
 
435 aa  255  1e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0958  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.76 
 
 
437 aa  252  9e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  36.91 
 
 
436 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4446  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.44 
 
 
435 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.89 
 
 
435 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  36.63 
 
 
435 aa  249  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2369  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 
424 aa  245  1e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3860  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 
438 aa  242  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00230775  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 
438 aa  241  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 
438 aa  240  3e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.9 
 
 
435 aa  241  3e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2000  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.99 
 
 
426 aa  239  9e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3598  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.51 
 
 
438 aa  239  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2198  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 
446 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1937  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  35.79 
 
 
431 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.74 
 
 
407 aa  215  1e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00140  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.69 
 
 
388 aa  198  1e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0333  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 
401 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.882916  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2615  FAD dependent oxidoreductase  35.67 
 
 
553 aa  176  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.489125  normal  0.819562 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0484  monooxygenase FAD-binding protein  35.01 
 
 
561 aa  166  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3065  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.16 
 
 
571 aa  153  6e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  31.55 
 
 
395 aa  146  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2059  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.57 
 
 
558 aa  131  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>