More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0037 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  100 
 
 
261 aa  527  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  99.23 
 
 
297 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  99.23 
 
 
261 aa  525  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  99.23 
 
 
297 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  99.23 
 
 
261 aa  525  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  98.85 
 
 
261 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  98.47 
 
 
297 aa  523  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  98.47 
 
 
261 aa  520  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  93.49 
 
 
261 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  93.87 
 
 
261 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  93.49 
 
 
261 aa  497  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  93.49 
 
 
261 aa  497  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  93.1 
 
 
261 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  85.82 
 
 
261 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  85.44 
 
 
261 aa  458  1e-128  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  82.38 
 
 
261 aa  445  1e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  54.47 
 
 
264 aa  264  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  57.31 
 
 
262 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  52.87 
 
 
260 aa  255  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  50.57 
 
 
260 aa  243  2e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6427  carnitinyl-CoA dehydratase  50.57 
 
 
260 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0773565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  46.84 
 
 
257 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  44.32 
 
 
265 aa  199  4e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
268 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  43.63 
 
 
259 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
261 aa  197  2e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  42.63 
 
 
249 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  42.63 
 
 
249 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.63 
 
 
249 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
797 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
259 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  43.24 
 
 
259 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 
266 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  43.63 
 
 
259 aa  189  6e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  43.63 
 
 
259 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.28 
 
 
264 aa  184  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.11 
 
 
271 aa  182  5e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  44.84 
 
 
266 aa  181  9e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.24 
 
 
265 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.24 
 
 
265 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 
257 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.24 
 
 
265 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 
261 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  42.42 
 
 
254 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 
261 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.32 
 
 
256 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 
258 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 
261 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.37 
 
 
269 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  39.1 
 
 
267 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.73 
 
 
265 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 
257 aa  166  3e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  42.53 
 
 
253 aa  165  7e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.54 
 
 
257 aa  164  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
261 aa  164  1e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 
259 aa  162  4e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 
253 aa  162  4e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  43.4 
 
 
254 aa  162  5e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
263 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 
261 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 
268 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
256 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
267 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  39.93 
 
 
258 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
257 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.55 
 
 
260 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 
258 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
249 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
260 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
247 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
247 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 
260 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
247 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.47 
 
 
260 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
256 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.47 
 
 
260 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
262 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  39.31 
 
 
260 aa  158  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 
257 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  39.47 
 
 
260 aa  158  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
257 aa  158  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.95 
 
 
269 aa  158  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
257 aa  158  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 
257 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.71 
 
 
266 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
260 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 
257 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 
254 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.02 
 
 
258 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.6 
 
 
260 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.2 
 
 
260 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
262 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  41.51 
 
 
254 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
270 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.85 
 
 
256 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
266 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
257 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 
262 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 
255 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
258 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>