More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0036 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  100 
 
 
196 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  96.94 
 
 
196 aa  393  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  97.96 
 
 
196 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  97.96 
 
 
196 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  97.45 
 
 
196 aa  391  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  97.45 
 
 
196 aa  391  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  97.45 
 
 
196 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  96.94 
 
 
196 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  85.13 
 
 
198 aa  349  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  85.13 
 
 
198 aa  349  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  85.13 
 
 
198 aa  349  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  84.62 
 
 
198 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  85.13 
 
 
198 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  69.23 
 
 
222 aa  287  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  68.21 
 
 
196 aa  286  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.37 
 
 
208 aa  254  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.67 
 
 
196 aa  245  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.67 
 
 
196 aa  245  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.67 
 
 
196 aa  245  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  59.49 
 
 
199 aa  240  8e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  57.65 
 
 
196 aa  240  8e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.76 
 
 
205 aa  239  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.46 
 
 
198 aa  235  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  57.22 
 
 
203 aa  235  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  57.44 
 
 
199 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  57.22 
 
 
195 aa  234  5e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  2.86211e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  56.92 
 
 
199 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  56.92 
 
 
199 aa  233  1e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.2 
 
 
200 aa  233  2e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  58.29 
 
 
200 aa  233  2e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  51.55 
 
 
202 aa  209  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  53.55 
 
 
196 aa  209  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  49.74 
 
 
199 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  46.2 
 
 
204 aa  192  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  43.32 
 
 
205 aa  176  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  49.42 
 
 
176 aa  168  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 
171 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  50 
 
 
175 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  39.88 
 
 
172 aa  127  1e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  41.88 
 
 
175 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  4.56928e-06  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  36.78 
 
 
175 aa  124  8e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  40.85 
 
 
173 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.62 
 
 
174 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  41.67 
 
 
173 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  37.79 
 
 
174 aa  121  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  37.5 
 
 
173 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.24 
 
 
166 aa  118  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.89901e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  36.63 
 
 
174 aa  117  1e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  3.53278e-06 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  38.99 
 
 
174 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  38.24 
 
 
261 aa  115  4e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  41.45 
 
 
171 aa  115  5e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  3.09138e-13 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  36.48 
 
 
175 aa  114  8e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  36.21 
 
 
174 aa  114  1e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  37.11 
 
 
174 aa  114  1e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  37.65 
 
 
173 aa  114  1e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  35.29 
 
 
174 aa  113  1e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  37.5 
 
 
157 aa  114  1e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  37.06 
 
 
172 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44308e-09 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  36.48 
 
 
174 aa  112  4e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  38.69 
 
 
188 aa  111  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  36.65 
 
 
174 aa  111  7e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  6.71897e-07 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  37.18 
 
 
163 aa  111  8e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  34.1 
 
 
174 aa  110  1e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  36.65 
 
 
178 aa  110  1e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  36.25 
 
 
175 aa  110  1e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  36.81 
 
 
174 aa  110  2e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  36.2 
 
 
174 aa  110  2e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  37.87 
 
 
180 aa  110  2e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  35.48 
 
 
170 aa  109  2e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  8.49084e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  39.13 
 
 
183 aa  110  2e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  36.81 
 
 
174 aa  110  2e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0151  hexapaptide repeat-containing transferase  35.39 
 
 
179 aa  109  2e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.240687  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  36.97 
 
 
180 aa  110  2e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  36.65 
 
 
174 aa  109  2e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  36.2 
 
 
174 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  31.61 
 
 
174 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  36.2 
 
 
174 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  35.22 
 
 
168 aa  109  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  36.02 
 
 
174 aa  108  4e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  36.54 
 
 
182 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  37.28 
 
 
180 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  37.87 
 
 
183 aa  108  7e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  35.4 
 
 
174 aa  107  8e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  35.4 
 
 
174 aa  107  8e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  37.28 
 
 
182 aa  107  8e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  38.62 
 
 
189 aa  107  9e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  33.54 
 
 
171 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.0495e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  37.87 
 
 
182 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  37.87 
 
 
182 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  35.42 
 
 
154 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  37.87 
 
 
182 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  38.6 
 
 
176 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  34.78 
 
 
192 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  36.47 
 
 
194 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  40.74 
 
 
171 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  34.93 
 
 
162 aa  106  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  38.26 
 
 
174 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0023  hypothetical protein  37.04 
 
 
171 aa  106  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.727004  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.22 
 
 
175 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  34.78 
 
 
174 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>