13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0035 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00038  DNA-binding transcriptional activator  100 
 
 		 131 aa  269  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3565  DNA-binding transcriptional activator CaiF  100 
 
 		 131 aa  269  8.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3621  DNA-binding transcriptional activator CaiF  100 
 
 		 131 aa  269  8.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923906  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0035  DNA-binding transcriptional activator CaiF  100 
 
 		 131 aa  269  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0038  DNA-binding transcriptional activator CaiF  100 
 
 		 131 aa  269  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00037  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  269  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0038  DNA-binding transcriptional activator CaiF  98.47 
 
 		 131 aa  267  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0036  DNA-binding transcriptional activator CaiF  98.47 
 
 		 131 aa  267  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3258  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.06097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3360  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3244  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0466052 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3195  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3179  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>