More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0025 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
164 aa  330  4e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
164 aa  330  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
164 aa  330  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
164 aa  330  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  99.39 
 
 
164 aa  330  7e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  99.39 
 
 
164 aa  330  7e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  99.39 
 
 
164 aa  328  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  99.39 
 
 
164 aa  328  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  98.78 
 
 
164 aa  328  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  92.07 
 
 
166 aa  307  3e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  92.07 
 
 
166 aa  307  3e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  92.07 
 
 
166 aa  307  3e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  91.46 
 
 
166 aa  306  1e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  91.46 
 
 
166 aa  306  1e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  88.41 
 
 
166 aa  303  6e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  80.38 
 
 
170 aa  265  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  79.75 
 
 
170 aa  262  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  68.1 
 
 
169 aa  233  1e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  68.1 
 
 
169 aa  233  1e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  76.69 
 
 
169 aa  229  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  66.87 
 
 
169 aa  228  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  66.26 
 
 
170 aa  224  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  60.12 
 
 
168 aa  212  1e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  55.35 
 
 
171 aa  181  5e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  51.23 
 
 
169 aa  176  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  51.85 
 
 
168 aa  175  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  53.09 
 
 
171 aa  175  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  51.83 
 
 
170 aa  175  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 
176 aa  173  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 
171 aa  171  4e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  51.22 
 
 
170 aa  171  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  51.22 
 
 
170 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  51.22 
 
 
170 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  51.53 
 
 
170 aa  170  6e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  50.92 
 
 
176 aa  170  6e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 
171 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 
171 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 
171 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 
168 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  50.61 
 
 
170 aa  168  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
171 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  51.61 
 
 
182 aa  167  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  46.25 
 
 
165 aa  165  3e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  48.1 
 
 
170 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  47.56 
 
 
180 aa  157  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  49.02 
 
 
154 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  45.06 
 
 
173 aa  153  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 
182 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  51.28 
 
 
173 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  48 
 
 
164 aa  145  2e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0557  signal peptidase II  50.65 
 
 
167 aa  143  1e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  42 
 
 
158 aa  139  2e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  48.08 
 
 
170 aa  137  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  46.05 
 
 
165 aa  137  8e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  38.65 
 
 
172 aa  136  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 
163 aa  136  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  47.5 
 
 
178 aa  135  3e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  46.58 
 
 
154 aa  134  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  46.25 
 
 
235 aa  133  1e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  52.71 
 
 
181 aa  133  1e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  46.58 
 
 
154 aa  133  1e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  47.55 
 
 
163 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 
202 aa  131  4e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  47.68 
 
 
165 aa  131  4e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  47.65 
 
 
165 aa  130  7e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  47.1 
 
 
171 aa  130  1e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  43.36 
 
 
163 aa  129  2e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  47.4 
 
 
166 aa  129  2e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  47.71 
 
 
160 aa  129  2e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  46.9 
 
 
164 aa  129  2e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 
166 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  43.51 
 
 
166 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  43.51 
 
 
166 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  43.51 
 
 
166 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  43.51 
 
 
166 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  43.51 
 
 
166 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  43.51 
 
 
166 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  43.51 
 
 
166 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  43.51 
 
 
166 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  45.75 
 
 
159 aa  128  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  47.55 
 
 
162 aa  128  4e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 
176 aa  127  5e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  49.66 
 
 
164 aa  127  7e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 
173 aa  126  1e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 
168 aa  126  2e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 
169 aa  125  2e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  44.68 
 
 
179 aa  125  2e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 
166 aa  125  2e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  6.40597e-09 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  44.76 
 
 
166 aa  124  4e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  44.06 
 
 
166 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  44.06 
 
 
166 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  44.06 
 
 
166 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  4.08677e-06 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 
167 aa  124  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 
169 aa  124  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  43.36 
 
 
166 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 
170 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 
170 aa  122  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  43.36 
 
 
166 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  3.63425e-05 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  43.45 
 
 
178 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 
170 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>