More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0012 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3505  molecular chaperone DnaK  64.62 
 
 
640 aa  844  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00228392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0017  molecular chaperone DnaK  100 
 
 
638 aa  1290  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00276008  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1406  chaperone protein DnaK  61.34 
 
 
642 aa  721  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.343406 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2497  molecular chaperone DnaK  71.1 
 
 
653 aa  929  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27144  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0128  chaperone protein DnaK  66.25 
 
 
632 aa  844  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860677  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1455  molecular chaperone DnaK  72.54 
 
 
638 aa  934  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2052  chaperone protein DnaK  58.62 
 
 
633 aa  723  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0669  molecular chaperone DnaK  72.07 
 
 
650 aa  941  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0739074  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1484  molecular chaperone DnaK  71.25 
 
 
640 aa  919  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.840075  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2576  molecular chaperone DnaK  71.94 
 
 
646 aa  931  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000174764 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1512  molecular chaperone DnaK  72.54 
 
 
638 aa  934  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.758728  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6270  chaperone protein DnaK  66.77 
 
 
639 aa  852  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0721  molecular chaperone DnaK  71.91 
 
 
650 aa  937  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381961  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3583  molecular chaperone DnaK  78.12 
 
 
640 aa  1012  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.281206  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3919  chaperone protein DnaK  68.91 
 
 
638 aa  881  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0705  molecular chaperone DnaK  75.35 
 
 
642 aa  974  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.991542  hitchhiker  0.00373159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0012  molecular chaperone DnaK  100 
 
 
638 aa  1290  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0737  molecular chaperone DnaK  71.12 
 
 
650 aa  934  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0364172  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2870  molecular chaperone DnaK  72.28 
 
 
650 aa  942  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01185  molecular chaperone DnaK  73.09 
 
 
641 aa  953  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0550021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4464  molecular chaperone DnaK  61.87 
 
 
609 aa  763  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2283  chaperone protein DnaK  58.37 
 
 
632 aa  720  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02253  molecular chaperone DnaK  81.19 
 
 
642 aa  1048  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.402968  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0013  molecular chaperone DnaK  96.87 
 
 
638 aa  1232  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.767779  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0013  molecular chaperone DnaK  96.87 
 
 
638 aa  1232  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0013  molecular chaperone DnaK  96.87 
 
 
638 aa  1231  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1600  molecular chaperone DnaK  72.81 
 
 
641 aa  939  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.56491  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2156  molecular chaperone DnaK  57.97 
 
 
640 aa  746  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0755  molecular chaperone DnaK  59.91 
 
 
640 aa  755  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.197988  normal  0.199452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0336  molecular chaperone DnaK  67.29 
 
 
631 aa  843  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0107713  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1707  molecular chaperone DnaK  58.59 
 
 
642 aa  748  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108281  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0481  molecular chaperone DnaK  59.13 
 
 
632 aa  739  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.995968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2829  molecular chaperone DnaK  63.62 
 
 
639 aa  829  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000221772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0761  molecular chaperone DnaK  58.37 
 
 
639 aa  736  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3142  chaperone protein DnaK  69.45 
 
 
639 aa  875  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  56.49 
 
 
621 aa  704  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3642  molecular chaperone DnaK  100 
 
 
638 aa  1290  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297376  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3594  molecular chaperone DnaK  91.22 
 
 
636 aa  1160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107379  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0004  molecular chaperone DnaK  65.2 
 
 
631 aa  830  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0827361  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01134  molecular chaperone DnaK  81.97 
 
 
638 aa  1047  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4392  chaperone protein DnaK  58.23 
 
 
615 aa  735  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253837  normal  0.258584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3734  chaperone protein DnaK  58.04 
 
 
622 aa  733  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03994e-08 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1378  molecular chaperone DnaK  74.71 
 
 
656 aa  923  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0350  molecular chaperone DnaK  68.65 
 
 
631 aa  870  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.759772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3574  chaperone protein DnaK  65.93 
 
 
639 aa  829  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.662017  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0148  molecular chaperone DnaK  58.52 
 
 
625 aa  727  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0238648  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1119  molecular chaperone DnaK  57.19 
 
 
634 aa  707  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3466  molecular chaperone DnaK  91.07 
 
 
636 aa  1157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.2983e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1258  molecular chaperone DnaK  58.47 
 
 
623 aa  695  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.757771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4474  molecular chaperone DnaK  61.7 
 
 
608 aa  749  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306982  normal  0.169072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2233  chaperone protein DnaK  58.02 
 
 
629 aa  719  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.1601  hitchhiker  0.0019124 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  57.88 
 
 
611 aa  689  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0790  molecular chaperone DnaK  68.34 
 
 
636 aa  884  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0357423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3411  molecular chaperone DnaK  78.87 
 
 
639 aa  1020  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.82343e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5481  molecular chaperone DnaK  77.97 
 
 
637 aa  1009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0015  molecular chaperone DnaK  99.84 
 
 
638 aa  1289  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0014  molecular chaperone DnaK  100 
 
 
638 aa  1290  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.720404  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2046  molecular chaperone DnaK  58.83 
 
 
623 aa  730  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000592664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4728  molecular chaperone DnaK  75.2 
 
 
641 aa  960  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  56.85 
 
 
612 aa  713  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2960  chaperone protein DnaK  69.76 
 
 
639 aa  886  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0797  molecular chaperone DnaK  91.22 
 
 
636 aa  1160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.18812e-05  normal  0.123842 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1439  molecular chaperone DnaK  74.71 
 
 
656 aa  923  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2633  molecular chaperone DnaK  72.91 
 
 
648 aa  949  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5231  molecular chaperone DnaK  73.07 
 
 
648 aa  934  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3537  molecular chaperone DnaK  78.87 
 
 
639 aa  1020  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0350653  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18401  molecular chaperone DnaK  55.07 
 
 
634 aa  702  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.188042  normal  0.971493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0440  chaperone protein DnaK  60.7 
 
 
618 aa  741  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00195865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0313  chaperone protein DnaK  57.82 
 
 
626 aa  724  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.65757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3571  molecular chaperone DnaK  66.25 
 
 
639 aa  843  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0070  chaperone protein DnaK  62.11 
 
 
642 aa  786  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3080  molecular chaperone DnaK  78.53 
 
 
638 aa  1010  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.312275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0692  molecular chaperone DnaK  89.81 
 
 
637 aa  1137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00232011  hitchhiker  0.00343274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3409  molecular chaperone DnaK  78.91 
 
 
640 aa  1021  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0543718  hitchhiker  0.00118284 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3964  molecular chaperone DnaK  74.96 
 
 
637 aa  976  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.734974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3373  chaperone protein DnaK  55.83 
 
 
633 aa  708  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0334464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0303  molecular chaperone DnaK  62.21 
 
 
637 aa  786  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2003  chaperone protein DnaK  58.49 
 
 
630 aa  732  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.05798e-07  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  57.98 
 
 
616 aa  713  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3072  chaperone protein DnaK  55.97 
 
 
636 aa  709  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0257567  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0094  chaperone protein DnaK  59.09 
 
 
634 aa  754  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.512015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2893  molecular chaperone DnaK  61.28 
 
 
635 aa  777  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000189329  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00650  chaperone protein DnaK  57.59 
 
 
642 aa  718  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0257003  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01160  chaperone protein DnaK  58.26 
 
 
636 aa  741  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.548876  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1857  chaperone protein DnaK  61.88 
 
 
634 aa  793  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.48681  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4082  chaperone protein DnaK  56.39 
 
 
635 aa  725  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6430  chaperone protein DnaK  58.66 
 
 
634 aa  751  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0661319  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0633  chaperone protein DnaK  60.09 
 
 
639 aa  762  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.840068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1226  molecular chaperone DnaK  56.86 
 
 
639 aa  722  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0242304  hitchhiker  0.00191345 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3574  molecular chaperone DnaK  65.07 
 
 
640 aa  841  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3659  molecular chaperone DnaK  89.66 
 
 
635 aa  1143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.221708  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0542  molecular chaperone DnaK  90.75 
 
 
636 aa  1144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241891  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3591  molecular chaperone DnaK  54.23 
 
 
632 aa  685  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143132  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  55.06 
 
 
605 aa  687  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  58.84 
 
 
607 aa  716  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2048  chaperone protein DnaK  55.42 
 
 
622 aa  710  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00388714  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07165  molecular chaperone DnaK  60.28 
 
 
636 aa  725  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.703004  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0004  chaperone protein DnaK  60.84 
 
 
638 aa  752  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0408404  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2047  chaperone protein DnaK  56.71 
 
 
630 aa  704  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0460  chaperone protein DnaK  72.84 
 
 
643 aa  920  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.299564  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>