16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0011 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0011  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  275  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.34103  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0013  hypothetical protein  97.76 
 
 
134 aa  271  2e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156774  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0012  hypothetical protein  97.76 
 
 
134 aa  271  2e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.892717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3643  hypothetical protein  97.76 
 
 
134 aa  271  2e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00013  hypothetical protein  97.01 
 
 
134 aa  271  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00013  hypothetical protein  97.01 
 
 
134 aa  271  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3584  conserved hypothetical protein  96.27 
 
 
134 aa  269  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.344933  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0013  hypothetical protein  96.27 
 
 
134 aa  268  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.813164  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0011  hypothetical protein  84.33 
 
 
134 aa  237  3e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0011  hypothetical protein  84.33 
 
 
134 aa  237  3e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.624687  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0011  hypothetical protein  83.97 
 
 
131 aa  231  2e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.179611  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0011  hypothetical protein  83.97 
 
 
131 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.495338  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0011  hypothetical protein  83.21 
 
 
131 aa  229  7e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0383661  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0016  hypothetical protein  95.16 
 
 
68 aa  129  1e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00570243  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0012  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.143731  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0683  hypothetical protein  31.43 
 
 
264 aa  48.9  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00242223  normal  0.861535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>